基本介紹
- 中文名:蛋白質模體
- 出處:生物化學(第3版)
蛋白質模體指的是由2個或3個具有二級結構的肽段,在空間上相互接近,形成一個特殊的空間結構。它具有特徵性的胺基酸排列順序,並且同特定的功能相聯繫。蛋白質分子中由胺基酸殘基空間排布形成具有特定生物學功能的結構模式。鋅指結構由1個...
模體(motif)是結構域的亞單位 通常由2~3二級結構單位組成,一般為α螺旋、β摺疊和環(loop)。結構域的特點 (1)結構域是球狀蛋白質的獨立摺疊單位。對一些較小的球狀蛋白質分子來說,結構域和三級結構是一個意思。例如紅氧還...
同源異形蛋白質,含有同源異形結構域模體的蛋白質。中文名稱 同源異形蛋白質 定 義 一類含有同源異形結構域(約60個胺基酸)模體的蛋白質。這類DNA結合結構域由保守的同源異形框(180 bp)編碼。廣泛存在於真核生物中,調節高等動物(尤其是...
蛋白質是多肽鏈 遺傳密碼規定了20種胺基酸的側鏈 半朧氨酸可形成二流鍵 肽單元是蛋白質結構的建築構件 甘氨酸可以適應許多不同的構象 某些側鏈構象是能量有利的 許多蛋白質含固有的金屬原子 結論 第2章 蛋白質結構的模體 蛋白質的內部...
《對域/肽識別中線性模體的結構生物信息學分析》是依託西南交通大學,由田菲菲擔任項目負責人的青年科學基金項目。項目摘要 線性模體是在序列局部範圍決定蛋白質特定生物學功能的胺基酸特徵排列模式;先前對其研究多在一級序列水平開展,卻無法...
小清蛋白 小清蛋白是2008年公布的生物化學與分子生物學名詞。定義 一類肌肉中的鈣結合蛋白(約12 kDa)。小清蛋白α具有EF手形模體,參與肌肉的收縮。出處 《生物化學與分子生物學名詞》。
ATP結合位點由一個P環構成,類似於驅動蛋白,說明肌動蛋白和驅動蛋白的運動有一個相似的與ATP有關的構象變化機制。頸部 肌球蛋白的頸部由一個長的α螺旋構成,攜帶1到6個特有的IQ模體。這些IQ模體有致的鈣調蛋白結合序列(QXXXRGXXX...
遺傳性質穩定、不易改變的蛋白質。詞語解釋 在基因組研究中的一個主要課題是進化研究,這方面的研究對功能提示,藥物設計等方面有很大意義。但是,進化研究是一項state-of-art的工作,有許多需要主要的問題。本文是發表在TIBS的兩篇letters...
識別蛋白 識別蛋白(recognition protein)是2019年全國科學技術名詞審定委員會公布的植物學名詞,出自《植物學名詞》第二版。定義 在雌雄配子間起識別作用的蛋白質。出處 《植物學名詞》第二版。
人們可通過對蛋白質家族成員的比較,得到多種物種進化的重要證據。在體內還發現,2個或2個以上蛋白質家族之間其胺基酸序列相似度不高,但有發揮相似作用的同一模體結構,通常將這些蛋白質家族歸類為“超家族”(superfamily),“超家族”...
結構模體 結構模體是2008年公布的生物化學與分子生物學名詞.定義 核酸或蛋白質分子上的亞序列或亞結構。通常具有某種功能。出處 《生物化學與分子生物學名詞》。
第9章 蛋白質結構的隱馬氏模型預測 9.1 基於序列模體的HMM模型預測β-筒型蛋白質結構 9.2 含4類子模型的HMM模型預測β-筒型蛋白質結構 9.3 表示摺疊股方向的HMM模型預測β-筒型蛋白質結構 第10章 基於物理化學性質的結構辨識...
基序,亦稱模序、模體。是指DNA、蛋白質等生物大分子中的保守序列,介於二級和三級結構之間的另一種結構層次。所謂結構域指蛋白質亞基結構中明顯分開的緊密球狀結構區域,亦稱轄區。多肽鏈首先是在某些區域相鄰的胺基酸殘基形成有規則的二級...
亮氨酸拉鏈(leucine zipper):出現在DNA結合蛋白質和其它蛋白質中的一種結構基元(motif),即模體。當來自同一個或不同多肽鏈的兩個兩用性的α-螺旋的疏水面(常常含有亮氨酸殘基)相互作用形成一個圈對圈的二聚體結構時就形成了亮...
模體(motif)是蛋白質分子中具有特定空間構象和特定功能的結構成分。其中一類就是具有特殊功能的超二級結構。一個模體總有其特徵性的胺基酸序列,並發揮特殊的功能。一般而言,常見的motion有以下幾種形式:有規則地聚集在一起形成全由α-...
布羅莫結構域是2008年公布的生物化學與分子生物學名詞。定義 真核生物蛋白質模體,果蠅brm基因表達產物,存在於參與染色質活化或具有促有絲分裂信號作用的核蛋白,含61~63(或~110)個保守的胺基酸殘基,結合於核小體組蛋白N端乙醯賴氨...
又稱羅斯曼摺疊模式,是一種由兩個重複的部分組成,每個部分包括6個平行的β摺疊與兩對α螺旋形成β-α-β-α-β的拓撲結構的蛋白質結構基序,常見於核苷酸結合蛋白質,特別是輔因子NAD結合蛋白。與結構域區別 超二級結構(super...
由於結構域之間連線的柔韌性,每個結構域可進行較大幅度的相對運動,使裂隙開放或關閉,便於蛋白質分子與其他分子之間的相互作用,故這些部位往往是活性中心所在的部位,或是變構物結合的部位。區別 模體(motif)即超二級結構,簡言之,...
鋅指的N-端有一對半胱氨酸殘基,C-端有一對組氨酸殘基,這四個殘基在空間上形成一個洞穴,恰好容納一個Zn離子,由於Zn離子可穩定模體中α-螺旋結構,致使此α-螺旋能鑲嵌於DNA的大溝中,因此含鋅指結構的蛋白質都能與DNA或RNA結合...
克羅莫結構域是2008年公布的生物化學與分子生物學名詞。定義 染色質結構修飾結構域(chromatin organization modifier domain)的縮寫。真核生物蛋白質模體之一,高度保守,含30~50個胺基酸,常結合甲基化胺基酸殘基,存在於動物、植物細胞核...
1.3.3 肌紅蛋白為球蛋白結構的複雜性提供了早期線索 1.3.4 球蛋白呈現出多種多樣的三級結構 1.3.5 多種球蛋白的分析揭示出了其共同的結構模式 1.3.6 蛋白質模體是蛋白質結構分類的基礎 1.3.7 蛋白質...
基元,基序或模序(motifs or modules,模體符)在許多蛋白質中,有兩個或三個具有二級結構的肽段在空間上相互接近,形成一個特殊的空間構象,稱為模序。有的將這種規則的二級結構的聚集體稱為超二級結構,它們可直接作為三級結構的“...
蛋白質序列具有與另一個蛋白質序列資料庫PIR的連結、與GPCR專門資料庫的連結,以及與蛋白質序列模體資料庫PROSITE的連結和與蛋白質結構域資料庫ProDom的連結。在DR行之後,是關鍵字行(KW)和特徵表行(FT)。特徵表包括對該序列特性的...