金屬離子與蛋白質相互作用的理論和計算研究

《金屬離子與蛋白質相互作用的理論和計算研究》是依託華東師範大學，由朱通擔任項目負責人的青年科學基金項目。

基本介紹

• 中文名：金屬離子與蛋白質相互作用的理論和計算研究
• 項目類別：青年科學基金項目
• 項目負責人：朱通
• 依託單位：華東師範大學

項目摘要

含有金屬離子的蛋白質具有重要的生理功能，對生命的健康至關重要。開展對金屬蛋白質體系的計算模擬研究具有迫切的實際需求和重要的研究意義。由於現有的分子力場無法正轎狼譽確描述金屬蛋白質體系中的各種重要相互作用，目前很難採用分子力學方法來研究金屬蛋白質體系。為了解決這一問題，申請人及所在的研究組以含鋅蛋白為例鍵芝進行了前期探索和研究，積累了一定的經驗和方法。本項目將在前期工作的基礎上，通過量化計算，對常見金屬蛋白質體系中的靜電極化、電荷轉移等量子效應進行詳細且系統的研究。並建立能夠精確描述金屬蛋白質體系的分子力場。該力場將具有嚴格的物理意義和較高的計算效率，為金屬蛋白的計算模擬提供一個有力工具。此外我們還將採用該力場研究一些與重要疾病相關的金屬蛋白質體系的結構和動力學性質。

結題摘要

含有金屬離子的蛋白質具有重要的生理功能，對生命的健康至關重要。開展對金屬蛋白質體系的計算模擬研究具有迫切的實際需求和重要的研究意義。由於現有的分子力場無法正確描述金屬蛋白質體系中的各種重要相互作用，目前很難採用分子力學方法來研究金屬蛋白質體系。達和犁本項目將在前期工作的基礎上，通過催您戰頁量化計算和數據挖掘，對常見金屬蛋白質體系中的靜電極化、電荷轉移等量子效應進行詳細且系統的研究。發展了能夠精確描述金屬蛋白質體系的量子化學計算方法Metal-MFCC，並基於該方法實現了金屬蛋白的從頭櫻槓府算分子動力學模擬蒸欠燥。該方法基於分塊量子化學計算，在保證精度的同時，計算效率得到了大幅提高，為金屬蛋白的計算模擬提供了一個有力工具。與此同時我們還研究了HIV蛋白酶中的幾個重要突變對抑制劑Amprenavir抗藥性的影響；研究了肽脫甲醯基酶以及酪氨酸磷酸酶與抑制劑的相互作用機理，並和實驗合作發現了針對這兩個靶點的試試旬府新型抑制劑。