《金屬離子誘導蛋白質聚集的分子動力學模擬》是依託南京大學，由李文飛擔任項目負責人的青年科學基金項目。
基本介紹
- 中文名：金屬離子誘導蛋白質聚集的分子動力學模擬
- 項目類別：青年科學基金項目
- 項目負責人：李文飛
- 依託單位：南京大學
- 批准號：10704033
- 申請代碼：A2014
- 負責人職稱：教授
- 研究期限：2008-01-01 至 2010-12-31
- 支持經費：19（萬元）
項目摘要
建立描述金屬離子與蛋白質相互作用的理論模型，結合最新的凝聚態統計物理構象採樣技術，利用全原子分子動力學模擬金屬離子誘導老年痴呆症等神經退行性疾病致病蛋白的聚集過程，從原子層次上認識金屬離子誘導蛋白質聚集的詳細分子機制與一般規律，進而從物理的角度揭示老年痴呆症等神經退行性疾病的致病機理，並為尋找治療相關疾病的新突破口提供理論依據。內容包括：通過考慮電荷轉移與質子化效應建立描述金屬離子與蛋白質原子間配位相互作用的理論模型；通過大規模並行計算實現構象空間充分採樣，構造金屬離子誘導老年痴呆症致病蛋白Aβ單體構象轉變自由能面，提取金屬離子誘導蛋白質單體構象轉變與錯誤摺疊的具體機制；模擬金屬離子誘導Aβ及其它神經退行性疾病致病蛋白的寡聚化過程及聚集物生長過程，理解金屬離子與蛋白質相互作用誘導蛋白質聚集的詳細機制及其對溫度、pH值及鹽濃度等外部因素的依賴性，並進一步尋找抑制金屬離子病理性結合的有效途徑。
