最早發現野生黃瓜的是植物學家J.F.Royle，他於1835年在尼泊爾的喜馬拉雅山南麓發現有苦味的野生黃瓜，並訂名為哈氏黃瓜（Cucumis hardwickii Royle），發表於《喜馬拉雅山植物》（Bot.Himal.Mts）上。1866 年，阿列菲爾德（Alefeld）認為，哈氏黃瓜不能是獨立的種，而是黃瓜種下的類型，即Cucumis sativus L. hardwickii（Royle）Alefeld。1932年，蘇聯卡巴耶夫（Gabaev）將哈氏黃瓜訂為變種，列在黃瓜種下：Cucumis sativus L. var. hardwickii（Royle）Gabaev。1875年8月T.Clarke從印度半島錫金邦向英國皇家邱園送去種子，在倫敦種植出苗後，經植物學家約瑟夫·胡克爵士（Sir Joseph D.Hooker）鑑定，1876年訂名為黃瓜種下的半苦味野生變種——錫金黃瓜（Cucumis sativus L. var. sikkimensis Hooker）。1952年，印度學者查克拉瓦提（Chakravaty）在《孟買自然歷史學會雜誌》（J. Bombay Nat. Hist. Soc）上，發表了從當時孟加拉國東北部、布拉馬普特拉河谷（即雅魯藏布江下游印度段）採集到的標本，訂名為野黃瓜種（Cucumis hystrix Chakr.），但這並不是該種的唯一標本。實際上，早在19世紀至20世紀初，已經有多份從不同國家採集的標本被記錄，據美國小柯克布萊德（J. H. Kirkbride. Jr）1993年報導，這些早期的標本有：1912年在緬甸紅寶石礦區所采的標本，1900-1939年在中國雲南省採集的標本，以及1914-1958年在泰國採集的標本。值得注意的是，中國植物分類前輩吳征鎰先生曾訂名一個雲南黃瓜種（Cucumis yunnanensis Cucumis Y.Wu），並於1980年在《東亞葫蘆科植物》（The Cucurbitaceae of Eastern Asia）發表，但傑弗里認為，雲南黃瓜與野黃瓜（Cucumis hystrix Chakr.）是同物異名，因此是無效的。
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