鄂爾多斯市食品藥品稽查支隊是鄂爾多斯市食藥局直屬單位。
擬訂並組織實施國家、自治區有關食品（包括保健食品，下同）、藥品、醫療器械、化妝品監督管理稽查制度；承擔全市食品、藥品、醫療器械、化妝品生產、流通和餐飲服務的監督管理與稽查工作；負責制定全市職責範圍內食品藥品監督抽驗計畫並組織實施；依法組織查處食品、藥品、醫療器械、化妝品質量安全事故；承擔查處或移送全市範圍內的食品、藥品、醫療器械、化妝品違法案件；承擔食品、藥品、醫療器械、化妝品廣告的監測和移送工作；承擔網際網路違法違規食品、藥品、醫療器械、化妝品信息服務和交易行為的查處工作；承擔全市食品、藥品、醫療器械、化妝品安全質量投訴舉報的受理、轉辦、核查和處理情況的回覆以及有關業務諮詢工作，管理12331投訴舉報信息平台；承擔指導和監督全市的稽查執法、產品召回（包括處置）和案件查處工作；負責處理上級部門交辦的違法案件和其它省市區要求協查的案件；承擔重大藥品、醫療器械、化妝品安全事故應急處置和調查處理工作，指導協調各地藥品、醫療器械、化妝品安全事件應急處置工作；承擔全市重大活動食品安全保障工作；配合相關科室做好全市食品藥品企業信用等級評定工作；承辦市食品藥品監督管理局交辦的其他事項。
