鄂爾多斯市食品檢驗檢測中心是鄂爾多斯市食藥局直屬單位。
承擔轄區內食品的監督檢驗、復驗和委託檢驗等工作;負責收集、整理、綜合上報和反饋食品質量信息,提供質量公告所需的技術數據和質量分析報告;開展食品的質量標準、檢驗方法、標準物質及相關安全性、有效性的研究工作;承擔對下級同類檢驗機構業務技術工作的指導、協調和檢驗項目資格認定的組織實施工作;承擔對轄區內食品生產、經營企業、餐飲服務單位的業務指導和培訓工作;配合市食品藥品監督管理局開展全市食品生產許可申請資格、資料審查和技術評審工作;承擔自治區、市級食品藥品監督管理部門交辦的其他工作。