基本介紹
- 藥品名稱:變位病毒科
- 外文名:Metaviridae
中文名稱,英文名稱,分類類型,分類,變位病毒科成員,變位病毒科基本特性,
中文名稱
變位病毒科
英文名稱
Metaviridae
分類類型
科
分類
變位病毒科
變位病毒科成員
屬 種 變位病毒屬(Metavirus) 擬南芥Athila病毒(Arabidopsis thaliana Athila virus) 擬南芥Tat4病毒(Arabidopsis thaliana Tat4 virus) 家蠶mag病毒(Bombyx mori mag virus) 美麗線蟲Cer1病毒(Caenorhabditis elegans Cer1 virus) 芽枝霉T-1病毒病毒(Cladosporium fulvum T-1 virus) 盤基網柄菌Skipper病毒(Dictyostelium discoideum Skipper virus) 果蠅Osvaldo病毒(Drosophila buzzatii Osvaldo virus) 黑腹果蠅412病毒(Drosophila melanogaster 412 virus) 黑腹果蠅mdg1病毒(Drosophila melanogaster mdg1 virus) 黑腹果蠅mdg3病毒(Drosophila melanogaster mdg3 virus) 黑腹果蠅micropia病毒(Drosophila melanogaster micropia virus) 黑果蠅Ulysses病毒(Drosophila virilis Ulysses virus) 鐮刀菌Skippy病毒(Fusarium oxysporum Skippy virus) 湖北百合 del1病毒(Lilium henryi del1 virus) 啤酒酵母Ty3病毒(Saccharomyces cerevisiae Ty3 virus) 裂殖酵母Tf1病毒(Schizosaccharomyces pombe Tf1 virus) 裂殖酵母Tf2病毒(Schizosaccharomyces pombe Tf2 virus) 紅鰭東方魨Sushi病毒(Takifugu rubbripes Sushi virus) 赤擬谷盜Woot病毒(Tribolium castaneum Woot virus) 三列海膽SURL病毒(Tripneustis gratilla SURL virus) 漂移病毒屬(Errantivirus) 地中海實蠅yoyo病毒(Ceratitis capitata Yoyo virus) 鳳梨果蠅Tom病毒(Drosophila ananassae Tom virus) 6病毒(6 virus) 黑腹果蠅297病毒(Drosophila melanogaster 297 virus) 黑腹果蠅gypsy病毒(Drosophila melanogaster gypsy virus) 黑腹果蠅Idefix病毒(Drosophila melanogaster Idefix virus) 黑腹果蠅Tirant病毒(Drosophila melanogaster Tirant virus) 黑腹果蠅Zam病毒(Drosophila melanogaster Zam virus) 黑果蠅Tv1病毒(Drosophila virilis Tv1 virus) 粉紋夜蛾TED病毒(Trichoplusia ni TED virus) 遠源病毒屬(Semotivirus) 甘比亞按蚊Moose病毒(Anopheles gambiae Moose virus) 人蛔蟲Tas病毒(Ascaris lumbricoides Tas virus) 家蠶Pao病毒(Bombyx mori Pao virus) 美麗線蟲Cer13病毒(Caenorhabditis elegans Cer13 virus) 黑腹果蠅Bel病毒(Drosophila melanogaster Bel virus) 黑腹果蠅Roo病毒(Drosophila melanogaster Roo virus) 擬果蠅Ninja病毒(Drosophila simulans Ninja virus) 紅鰭東方魨Suzu病毒(Fugu rubripes Suzu virus) 黑果蠅Penelope病毒(Drosophila virilis Penelope virus)
變位病毒科基本特性
變位病毒科病毒粒子形態相對貧乏,衣殼對稱性未知。成員包括主要或完全在細胞內產生粒子的種類,因此,病毒粒子因成熟階段不同而出現多樣性。這些細胞顆粒稱為病毒樣顆粒(virus-like particle,VLP),而細胞外具有卵圓形核心的囊膜化顆粒稱為病毒粒子(virion)。產生VLP和病毒粒子的因子在本章中都作為反轉座子。
變位病毒科反轉座子基因組為正鏈RNA,基因組RNA 3’端多腺苷化,帽子結構雖未報導,但推測可能與反轉錄病毒的一些成員相似。除了基因組RNA,粒子中還存在一些細胞RNA,如細胞tRNA,這些細胞RNA在病毒複製中可發揮作用。病毒的蛋白種類主要由VLP的研究獲得,包括一個主要蛋白或稱為衣殼蛋白(CP)、一個天冬氨酸蛋白酶、一個含RNA酶H域的RNA反轉錄酶(RT-RH)和一個整合酶(IN)。對大多數因子而言,這些蛋白都沒有進行很好的特性研究,但可通過內部區域編碼蛋白序列的相似性推測。在大多數情況下,變位病毒CP與反轉錄病毒CP沒有明顯的相似性。本科的一些反轉座子VLP蛋白具有反轉錄病毒核衣殼的金屬指環特徵。漂移病毒屬成員與其它病毒的區別是,它們出現加工的囊膜蛋白,其中包括與反轉錄病毒跨膜蛋白(TM)和表面蛋白(SU)相對應的蛋白。這些反轉座子的整合形式由中心的獨特區域和側翼的長末端重複(LTR)組成,因子分子長度4-10kb,LTR的長度在家蠶mag病毒中為77nt,在果蠅Ullsses病毒和Tribolium castaneum Woot病毒中,其長度超過2kb,因子染色體拷貝的側翼是來源於插入位點的短直接重複序列,重複的長度是因子的特性,一般在4-6bp之間。中間區域包含1-3個ORF,在酵母Ty3病毒中,第二個ORF的3’端可擴展進入下游的LTR。在本科的所有成員中,ORF區域的排列順序為:5’-CA-(NC)-PR- RT-RH- IN- ENV-3’,囊膜蛋白是由切割mRNA第二個ORF的下游編碼。在不同的因子中,這些ORF稱謂不同,在本章中一般稱為gag、pol和env。因此,因子可能有一個(gag-pol)ORF、兩個(gag和pol)ORF或三個(gag、pol和env)ORF。基因組RNA轉錄從上游LTR起始,在下游LTR這一位點的下游終止,這將長末端重複序列分成基因組RNA的5’獨特末端(U5)和3’獨特末端(U3),或者是5’和3’末端的重複(R)。因此,LTR是由U3-R-U5區域組成,類似於整合反轉錄病毒的末端結構。基因組RNA翻譯蛋白需要粒子結構、多蛋白成熟、反轉錄和整合。這些因子的活化能引起宿主依賴插入位點生理學的破壞,許多成員表現為選擇性插入類型。在酵母Ty3病毒中,轉錄由交配外激素誘導,轉座在交配後發生。在果蠅Gyp病毒中,轉座發生在生殖細胞中。