漂移病毒屬

變位病毒科的一屬，包括地中海實蠅yoyo病毒， 鳳梨果蠅Tom病毒， 6病毒， 黑腹果蠅297病毒， 黑腹果蠅gypsy病毒， 黑腹果蠅Idefix病毒，黑腹果蠅Tirant病毒， 黑腹果蠅Zam病毒， 黑果蠅Tv1病毒， 粉紋夜蛾TED病毒等。

基本介紹

• 中文名：漂移病毒屬
• 外文名：Errantivirus
• 分類類型：屬

分類

變位病毒科＞漂移病毒屬

相關成員

地中海實蠅yoyo病毒（Ceratitis capitata Yoyo virus） 鳳梨果蠅Tom病毒（Drosophila ananassae Tom virus） 6病毒（6 virus） 黑腹果蠅297病毒（Drosophila melanogaster 297 virus） 黑腹果蠅gypsy病毒（Drosophila melanogaster gypsy virus） 黑腹果蠅Idefix病毒（Drosophila melanogaster Idefix virus） 黑腹果蠅Tirant病毒（Drosophila melanogaster Tirant virus） 黑腹果蠅Zam病毒（Drosophila melanogaster Zam virus） 黑果蠅Tv1病毒（Drosophila virilis Tv1 virus） 粉紋夜蛾TED病毒（Trichoplusia ni TED virus）

基本特性

果蠅gypsy病毒表現為不規則的粒子，具囊膜，直徑100nm，還有更小的無囊膜顆粒。根據env基因推測，囊膜蛋白相對分子質量為54×103，事實上的相對分子質量是66×103，蛋白的N端糖基化，對內糖苷酶敏感。

果蠅gypsy病毒基因組分子大小為7469bp，其中包括兩個482bp的LTR。與大多數反轉錄病毒和反轉座子不同，果蠅gypsy病毒LTR的末端是由AG…TT組成，而不是由TG…CA組成。

插入的DNA側翼包括4bp重複，插入位點選擇的是YRYRYR序列。

基因組RNA含有一個編碼主要結構蛋白的ORF；第二個ORF-1框重疊，編碼與反轉錄病毒PR、RT和IN同源的蛋白；第三個ORF在一個疊接的2.1kb mRNA中，編碼相對分子質量為54×103的囊膜蛋白，該蛋白N端糖基化，並能加工成較小的蛋白。這種蛋白是反轉錄蛋白囊膜蛋白的類似物，它通過疏水跨膜區域位於病毒膜，加工位點與跨膜和表面區域的切割相似。果蠅Tom病毒的囊膜蛋白已鑑定。

果蠅gypsy病毒轉錄成6.5kb的基因組RNA，242nt的強負鏈終止種類已鑑定。479nt的正鏈強終止DNA種類在長度上與LTR相似，但一個種類比tRNA引物拷貝產生的種類長15-18nt。在本屬成員中，不同種類病毒Gag序列的同源性低於50%。

gypsy因子與脊椎動物反轉錄病毒的原病毒（Provirus）最相似。每個轉座子都具有LTR，這些LTR分別與推定的tRNA引物結合位點（PBS）及多嘌呤區段（PP）相鄰近。在轉座子的中部還含有若干開讀框（ORF），與反轉錄病毒的gag，pol及env基因同源。

在gypsy家族內，中間ORF（pol）最保守，特別在那些含有反轉錄病毒蛋白分解酶、反轉錄酶及整合酶結構域序列相似性的區域。與其他昆蟲反轉錄轉座子（如Copia病毒）不同，gypsy家族內pol各結構域的排列次序與反轉錄病毒的完全一致。