謝尚潛

謝尚潛，1985年10月出生，浙江人，博士，海南大學教授。

基本介紹

  • 中文名：謝尚潛
  • 畢業院校：南京農業大學
  • 學位/學歷：博士
  • 專業方向：作物遺傳育種
  • 職稱：教授
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人物經歷

教育經歷

（1）2003年9月-2007年6月湖北大學，計算機科學與技術，本科
（2）2007年9月-2010年6月湖北大學，遺傳學，碩士
（3）2010年9月-2013年9月南京農業大學，作物遺傳育凳膠束種，博士

工作簡歷

2017年1月-至今海南大學放危剃教授
2014年7月-2016年12月中山大學中山眼科中心博士挨阿紋後

研究方向

林木基因組學、生物信息學

教授課程

本科生課程：熱帶園藝植物研究法
研究生課程：生物信息學謎糠

學術成果

長期從事生物信息學與數據分析的研究工作。本科畢業於計算機專業，碩士和博士分別進行數量遺傳學和統計基因組學領域研究，承達墓擔並於眼科學國家重點實驗室開展生物信息學方向的博士後研究，研究成果入選為“2015年度中國眼科學十大成就之一”。目前已在Nature Methods (IF=26)，Nucleic Acids Research (IF=11)等高水平雜誌發表SCI論文十餘篇，平均單篇影響因子近8；主持國家級科研項目2項，科研經費100多萬元，申請國家發明專利2項，軟體著作權2項。

科研項目

（1）國家自然科學基金，基於三代測序全長轉錄組的特殼驗鑽異性Isoform識別方法研究及特徵分析(31760316), 2018.01-2021.12，主持
（2）國家自然科學基金，基於多組學先驗信息的串聯質譜資料庫搜尋方法研究及套用(31600667), 2017.01-2019.12，主持
（3）海南大學科研啟動基金，三代測序數據高效校正方法及套用(KYQD(ZR)1721), 2017.01-2022.01，主持
（4）海南大學青年基金，三代測序全長轉錄組的基因表達豐度評估方法研究(hdkyxj201702), 2017.1-2018.12，主持
（5）中國博士後科學基金，融入核糖體譜乃匪匪拜豐度信息的質譜資料庫搜尋方法研究(2015M582460), 2015.10-2016.10，主持
（6）海南省重大科技計畫項目，熱帶花卉（三角梅、文心蘭）優質高效生產技術研究與示範(zdkj201815)，2018.5-2020.5，參加

學術論文

  1. Wen-Tai Ma#, Zhao-Yu Liu#, Xiao-Zhou Chen#, Zhen-Liang Lin, Zhong-Bing Zheng, Wei-Guo Miao*,Shang-Qian Xie*. A protein identification algorithm for tandem mass spectrometry by incorporating the abundance of mRNA into a binomial probability scoring model. 2019, Journal of Proteomics, 197:53-59 (Corresponding author, IF=3.7)
  2. J Li#, W Tang#, Y-W Zhang#, K-N Chen, C Wang, Y Liu, Q Zhan, C Wang, S-B Wang,Shang-Qian Xie*, L Wang*. Genome-Wide Association Studies for Five Forage Quality-Related Traits in Sorghum (Sorghum bicolorL.). 2018, Frontiers in Plant Science, 9: 1146 (Corresponding author, IF=3.7)
  3. Shang-Qian Xie#, Yue Han#, Xiao-Zhou Chen, Tai-Yu Cao, Kai-Kai Ji, Jie Zhu, Peng Ling* , Chuan-Le Xiao*. ISOdb: A comprehensive database of full-length isoforms generated by Iso-Seq. 2018, International Journal of Genomics, Article ID 9207637 (IF=1.9)
  4. Chuan-Le Xiao#,Shang-Qian Xie#, Qing-Biao Xie, Zhao-Yu Liu, Jian-Feng Xing, Kai-Kai Ji, Jun Tao*, Liangying Dai*, and Feng Luo*. N6-Methyladenine DNA modification in Xanthomonas oryzae pv. oryzicola genome, 2018, Scientific Reports, 8: 12672 (Co-first author, IF=4.1)
  5. Qian Yu#, Bingying Lin#,Shang-Qian Xie#, Song Gao, Wei Li, Yizhi Liu, Hong-Wei Wang, Danping Huang and Zhi Xie. A homozygous mutation p.Arg2167Trp in FREM2 causes isolated cryptophthalmos. 2018, Human molecular genetics, 27(13): 2357-2366 (Co-first author, IF=4.9)
  6. Chuan-Le Xiao, Song Zhu, Minghui He, De Chen, Qian Zhang, Ying Chen, Guoliang Yu, Jinbao Liu,Shang-Qian Xie, Feng Luo, Zhe Liang, De-peng Wang, Xiaochen Bo, Xiao-Feng Gu, Kai Wang and Guang-Rong Yan. N6-Methyladenine DNA Modification in the Human Genome. 2018, Molecular cell, 71(2): 306-318 (IF=15)
  7. Chuan-Le Xiao#, Ying Chen#,Shang-Qian Xie, Kai-Ning Chen, Yan Wang, Yue Han, Feng Luo, Zhi Xie. MECAT: fast mapping, error correction, and de novo assembly for single-molecule sequencing reads. 2017, Nature Methods, 14(11):1702-1704 (IF=26.9)
  8. Hongwei Wang#, Yan Wang#,Shang-Qian Xie, Zhi Xie. Global and Cell-type Specific Properties of LincRNAs with Ribosome Occupancy. 2017, Nucleic Acids Research, 45(5): 2786-2796 (IF=11.6)
  9. Shang-Qian Xie#, Peng Nie#, Yan Wang#, Hongwei Wang, Hongyu Li, Zhilong Yang, Yizhi Liu, Jian Ren, Zhi Xie. RPFdb: a database for genome wide information of translated mRNA generated from ribosome profiling. 2016, Nucleic Acids Research, 44: D254-258（“2015中國眼科十大成就”之一, IF=11.6）
  10. Shang-Qian Xie, Jian-Ying Feng, Yuan-Ming Zhang. Linkage group correction using epistatic distorted markers in F2 and backcross populations. 2014, Heredity, 112(5): 479-488 (IF=3.8)
  11. Shang-Qian Xie, JianGuo Chen, Bruce Walsh. Genetic mapping of sterile genes with epistasis in backcross designs. 2014, Heredity, 112(2): 165-171 (IF=3.8)
  12. Shang-Qian Xie, Jia Wen, Yuan-Ming Zhang. Multi-QTL mapping for quantitative traits using epistatic distorted markers. 2013, PLoS ONE, 8(7): e68510 (IF=3.5)
  13. Shang-Qian Xie, JianGuo Chen. A statistical method for genetic mapping of sterility genes that exhibit epistasis in remote hybridization of plants using molecular markers in an F2 population. 2012, Chin Sci Bull, 57(21): 2681-2687 (IF=1.2)

申請專利

  1. 謝尚潛，肖傳樂，謝志.基於多組學豐度信息的蛋白質二級質譜鑑定方法（專利號：201610737420.7）.
  2. 謝尚潛，劉宇梟，林加論，邢劍鋒.一種單細胞測序的數據分類方法（專利號：201811501781.7）

申請專利

  1. 謝尚潛，肖傳樂，謝志.基於多組學豐度信息的蛋白質二級質譜鑑定方法（專利號：201610737420.7）.
  2. 謝尚潛，劉宇梟，林加論，邢劍鋒.一種單細胞測序的數據分類方法（專利號：201811501781.7）

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