《蛋白質對接研究:動力學擾動分析方法》是依託復旦大學,由明燈明擔任項目負責人的面上項目。
基本介紹
- 中文名:蛋白質對接研究:動力學擾動分析方法
- 依託單位:復旦大學
- 項目類別:面上項目
- 項目負責人:明燈明
- 負責人職稱:研究員
- 批准號:30870509
- 研究期限:2009-01-01 至 2011-12-31
- 申請代碼:C0502
- 支持經費:32(萬元)
《蛋白質對接研究:動力學擾動分析方法》是依託復旦大學,由明燈明擔任項目負責人的面上項目。
《蛋白質對接研究:動力學擾動分析方法》是依託復旦大學,由明燈明擔任項目負責人的面上項目。項目摘要蛋白質對接是由已知蛋白質單體結構構建多蛋白質複合體結構的方法,是基於結構的蛋白質-蛋白質相互作用研究的重要手段,是計算結構生...
《基於RNA分子柔性分析的蛋白質-RNA分子對接方法研究》是依託北京工業大學,由李春華擔任項目負責人的面上項目。項目摘要 蛋白質-RNA相互作用與識別是目前生命科學研究的熱點,蛋白質-RNA對接方法研究具有重要的科學意義和套用價值。該項目在...
本課題的主要目標是研究蛋白質分子之間的遠程識別機制,我們將根據蛋白質分子之間遠程靜電相互作用的變化規律,分析蛋白質分子之間的最優對接方向和對接界面,縮小蛋白質複合物構象的搜尋空間,並使用分子動力學模擬的方法研究蛋白質複合物的...
研究方法 蛋白多肽類藥物的分析方法 1.1 生物檢定法 由於蛋白多肽類藥物多為有生物活性的物質,且生物活性不僅取決於藥物的一級結構,與二 、三級結構亦密切相關,故生物檢定法是研究該類藥物動力學獨特而必需的方法。生物檢定 法 有兩...
通過改造非線性阻尼形式、環境激勵作用形式等方面來更清楚地描述大分子的隨機動力學系統。通過把新發展的哈密頓分子動力學模擬方法套用於酶蛋白分子上的能量分布、蛋白質穩定性和構象變換等課題研究,來開展能量回響、隨機穩定性和可靠性分析...
本課題主要關注於蛋白複合體網路結構的構建,及其拓撲學和動力學分析。包括:(1)套用複雜網路的方法,建立蛋白複合體網路結構,研究蛋白-蛋白的相互作用機制。通過計算這些網路的各種網路參量,包括度分布,聚集係數,平均最短路徑,以及基...
研究蛋白質與藥物相互作用對闡明藥物的藥理活性和藥代動力學具有重要的理論意義、學術價值和套用前景。本課題擬以發光劑-功能蛋白質線上產生的化學發光信號為穩態光源,以功能蛋白質與小分子相互作用生成的複合體(或配合物)對該穩態光源的...
通過顯微技術直接觀察DNA與蛋白質及酶的結合過程,同時利用螢光成像及時間分辨技術來研究DNA與蛋白質及酶相互作用的動力學過程,從而建立一種分子水平的直觀的靈敏的研究DNA與蛋白質相互作用的表面分析化學新方法。將建立的新方法套用於環境...
通過GC-MD 動力學模擬和傘狀採樣(umbrella sampling) 計算了自由能沿構象變化反應坐標的變化,通過對軌線的詳細分析,得出了ABC輸出蛋白大尺度“開”“合”門控(gating)動力學機理,並清晰地描述了化學能到機械能的傳遞途徑。 2. ...
該研究目標是利用微流控技術和全內反射螢光顯微技術相結合,發展可用於細胞內蛋白複合物的相互作用、高通量、可視化的單分子檢測新方法。與傳統生物化學測量不同,單分子檢測可反映出單個蛋白分子的結構變化和動力學。研究首先擬發展微流控...
在高精度冷凍電鏡和分子影像等技術推動下,蛋白質研究逐步從分子水平向細胞、個體等更高維度發展,並注重對蛋白質在細胞、生物體中的“在體”研究。隨著同步輻射、核磁共振、原子力顯微鏡等分子結構分析技術的進步,蛋白質研究更加注重超...
涉及蛋白質分子模擬領域內最新的綜述和通用方法,學術思想新穎,內容包括蛋白質結構預測方法、蛋白質動力學、蛋白質摺疊機理及生物大分子相互作用等方面的理論和套用,涵蓋了各種不同的採樣技術、粗粒化模型、分子對接方法的原理與方法,以及...
分子模擬:包括一些分子結構模型化的方法,這些方法並不僅局限於量子力學理論的範疇。例如分子對接,蛋白質對接,藥物設計和組合化學等。分子動力學:套用經典力學或量子力學來模擬體系(原子和分子的集合)各原子核的運動,研究反應碰撞、過渡...
本項目在前期工作基礎上,將其進一步套用到金屬蛋白的研究中,正確描述金屬蛋白離子配位數和電荷在動力學過程中的變化。為了套用於更複雜的體系,提高計算效率,對量化計算的結果進行分析擬合,將新的極化電荷模型套用到蛋白質和蛋白質的...
第1章植物細胞生產研究套用依據 第2章植物細胞株的篩選方法 第3章苜蓿愈傷組織的誘導及蛋白質高含量細胞的選育 第4章主要營養成分對苜蓿細胞生長和蛋白質合成的影響 第5章苜蓿細胞培養過程中細胞生長和蛋白質合成的動力學分析 第6章苜蓿...