菌體生產法是以菌體為產品的發酵生產方法。微生物菌體中含有豐富的營養物質，蛋白質含量高達40%～80%，胺基酸組成齊全，還富含維生素、脂肪和糖類，對人類和畜、禽有較高的營養價值。其產品通常稱為單細胞蛋白(single cell protein，SCP)，可作為優良的蛋白質食品和動物飼料。微生物菌體或SCP的生產具有生長繁殖迅速，生產率高，可在大型發酵罐中培養，不占大面積耕地，不受季節變化、旱澇災害影響等優點。同時，可利用的原料非常廣泛，包括糖質、澱粉質、纖維質以及工農業廢棄物等再生資源，也可利用有機及無機礦物資源。根據原料的不同，選用的微生物有酵母、細菌、放線菌、絲狀真菌及藻類等。
微生物菌體(SCP)的生產始於1879年英國用通氣大桶生產麵包酵母。第一次世界大戰期間，法國首創以廢糖蜜為原料生產麵包酵母，並作為蛋白質添加使用。第二次世界大戰期間，法國又使用造紙廢液、木材水解液生產SCP。到了60年代，西方各國開始以石油及石油化工產品為原料生產SCP，英、法、意等國相繼建成以烷烴為原料生產烷烴酵母的工廠，英國的ICI公司以甲醇為原料生產細菌蛋白，後因石油價格上漲等原因普遍受阻。近年來，SCP的發展轉向糖質、澱粉質、纖維質等可再生資源的利用，並與廢水、廢渣等的淨化處理相結合。
