《結核分枝桿菌的分子進化與菌株耐藥性演化》是依託四川大學，由孫群擔任項目負責人的面上項目。
基本介紹
- 中文名：結核分枝桿菌的分子進化與菌株耐藥性演化
- 項目類別：面上項目
- 項目負責人：孫群
- 依託單位：四川大學
項目摘要,結題摘要,
項目摘要
耐藥結核分枝桿菌的產生和傳播是導致結核病在全球捲土重來的重要原因，研究其耐藥機制及耐藥性演化對控制結核病蔓延至關重要。本課題以分離自我國西南地區人群結核分枝桿菌臨床分離株為研究對象，在測定菌株耐藥譜的基礎上，分析結核分枝桿菌重要結構基因、看家基因、耐藥基因的單核苷酸多態性，通過對其遺傳結構、基因組多態性、系統進化、突變速率的分析，建立適合西南地區結核分枝桿菌的快速、高通量細菌分型方法，構建西南地區結核分枝桿菌的分子進化圖譜。在此基礎上，探討進化速率與耐藥性產生和演化的關係，分析用藥以及合併HIV感染等各種選擇壓對結核分枝桿菌的進化和耐藥性產生的影響，獲得結核分枝桿菌的基因組多態性及其微進化的規律，初步闡明耐藥結核分枝桿菌的產生和流行機制，為結核分枝桿菌的溯源、耐藥機制和致病機制的揭示奠定基礎。
結題摘要
收集了從2008年至2012年期間四川地區結核分枝桿菌臨床菌株共1125株，其中具完整臨床信息菌株為844株，包括MDR樣本427株和少數民族患者分離菌株61株。首次對四川地區異煙肼和利福平耐藥結核分枝桿菌相關耐藥突變進行了全面研究； 通過PCR直接測序方法，鑑定了四川地區耐異煙肼和利福平結核分枝桿菌臨床分離株中與耐藥相關的katG、inhA、furA、fabG1(mabA)、ahpC、oxyR’、ndh、kasA基因和rpoB基因的突變情況；探討了基因突變類型與四川地區流行的特定結核分枝桿菌家族的相關性；探索了不同基因的不同突變位點與耐藥性產生的互動作用；考察了特殊平耐藥突變位點與特定耐藥菌株家族的相關性；探索了四川地區異煙肼耐藥、利福平耐藥以及MDR-TB北京家族菌株的耐藥進化方式。通過基於Spoligotyping的分型方法對所採集到的結核分枝桿菌臨床分離株進行了家族劃分，研究了四川地區耐藥結核分枝桿菌的遺傳多樣性；使用Spoligotyping、24-locus MIRU-VNTR和IS6110-RFLP分型方法對耐藥菌株進行了基因分型，從而了解四川地區人群耐藥結核分枝桿菌臨床分離株的傳播動態和這三種分子分型方法在該地區的適用性。首次用DNA分型方法對四川地區的結核分枝桿菌特別是耐藥菌株進行了流行病學及與耐藥性關係的研究；建立了四川地區異煙肼和利福平耐藥結核分枝桿菌的分子快速檢測指標；建立了檢測結核分枝桿菌對RFP、INH、EMB耐藥性的多重PCR-反向斑點雜交技術對四川地區流行結核分枝桿菌耐藥進行快速檢測。
