秦嶺自然保護區群是秦嶺生物多樣性的精華所在，有著典型代表性，秦嶺自然保護區群的植物資源豐富、起源古老、區系複雜，分布典型。這裡既有華北、華中區系植物，也有東北和青藏高原地區植物，是我國南北植物的交會過渡地帶。已知保護區群內有種子植物約2940種，占秦嶺植物總數78．8%，苔蘚植物311種，占秦嶺總數82%，其中含世界性單種屬植物37屬，少種屬植物60屬，中國特有屬植物23屬，列為國家重點保護植物28種，在世界上具有特殊分布價值的獨葉草曾引起國內外學者關注。分布在海拔3000米以上的太白紅杉林，成為喬木樹種分布最高界，它的自然分布不僅對涵養水源、保持水土起到作用。而且對研究第四紀冰川地貌、氣候歷史等方面有著重要意義。
秦嶺自然保護區群是我國古北界和東洋界動物的交匯過渡地帶和分界線，這裡已發現獸類126種，鳥類338種，有國家保護動物大熊貓、金絲猴、羚牛、朱䴉等8種。
秦嶺的生物多樣性不僅在我國具有典型特殊性和代表性，而且在世界上也具有獨特性和代表性，引起世界各國人們重視和關注，為保護這一地區生物多樣性。全球環境基金資助具有世界意義生物多樣性自然保護區———自然保護區群作為亞洲示範點之一，項目已於1996年開始啟動，2001年結束，通過項目實施提高了自然保護區群保護能力和管理水平，起到了推動和示範作用，有力地促進了國際交流與合作，推動了我省自然保護事業發展。
