清華大學公共管理學院台資企業研究中心成立於2005年12月，是依託台灣研究所運作的一個跨學科、跨領域、跨兩岸的管理理論與政策研究中心。
清華大學公共管理學院台資企業研究中心中心在服務兩岸和平發展的大目標下，主要從事以下方面的研究：
- 一是研究兩岸經濟政策和台商投資及運營模式，促進兩岸經濟合作；
- 二是研究台灣企業經營思想、管理模式和發展趨勢，推動兩岸企業交流，提升兩岸企業管理水平；
- 三是研究地方投資環境，服務台資企業發展。
清華大學公共管理學院台資企業研究中心中心主要工作內容包括：
第一、自成立以來積極組織所內教師、博士後、研究助理及外部學者，開展各個行業優秀台資企業的案例研究，取得了一系列的成果。主要包括：《聯華電子——台灣晶圓雙雄之一》（華文出版社，2003.4）、《台資企業個案研究》（清華大學出版社，2005.1）、《招商引資——對台經濟合作的方法與策略》（清華大學出版社，2006.8）、《兩岸經濟關係20年》（人民出版社，2006.5）、《篳路藍縷——王永慶開創石化產業王國之路》（清華大學出版社，2007.1）、《經“贏”之道——台灣企業成功密拾》（清華大學出版社，2008.12）等。
第二、中心長期開展實地調研，了解不同時期、不同環境下大陸台資企業發展情況、所面臨的問題提供發展建議，並主辦《台資企業發展研究專題》通訊等。2005年以來，中心長期在江蘇崑山和淮安開展台資企業調研工作。2010年，中心在京津地區、成渝地區以及長三角地區開展《ICT產業發展狀況》的調研，總結台商在大陸ICT產業中的優勢與劣勢。2011年，中心在台商集中度長三角、珠三角和海西地區開展《台資企業轉型升級與在地化發展》的調研工作，發表研究報告等。
第三、舉辦台資企業發展諮詢與政策研討會。2006年7月，中心成立了台商發展研究諮詢委員會（簡稱“咨委會”），委員由台商協會創會會長、榮譽會長、知名台商組成，現任為第三屆“咨委會”（後附名單）。研究中心與“咨委會”每年召開兩次會議，對有關研究成果進行評價和分析，就大陸台資企業在發展中面臨的問題與大陸政策展開研討。近年來研討議題有：2008年，新《勞動契約法》出台後台商如何應對的問題；2009年，金融風暴之後台資企業轉型升級的問題；2010年，台資企業面臨的“轉移定價”的問題；2011年；大陸“十二五”規劃與台商商機；2012年，兩岸中小企業合作；2013年，“十八大”後大陸產業發展方向等。
第四、參與舉辦兩岸企業交流與合作論壇。從2009年開始，在國資委的直接領導下，我所和中智公司共同組織了“台塑合理化管理理論與實踐研討班”，時任國資委主任李榮融、出席開班儀式，我校校長顧秉林主持。40多位高層領導參加了研討班並親赴台塑企業考察，取得了豐碩成果，為兩岸學術交流開創了新的領域。2010年8月，由我所與台灣中華兩岸企業發展協進會共同發起，由國台辦經濟局、工信部中小企業司及台灣兩岸共同市場基金會為支持單位，在河北邯鄲磁縣召開了“首屆兩岸中小企業發展論壇”，此次論壇得到了商務部、科技部以及河北省領導和有關部門的大力支持。
