泛基因組:定義,特點,套用,

泛基因組

泛基因組（Pan-genome），指一個物種內所有基因組信息的總和，它比單一參考基因組涵蓋了更多的遺傳多樣性。

基本介紹

定義,特點,套用,

泛基因組（Pan-genome）是一個物種內所有基因組信息的總和。

賦能未來作物育種的基石的泛基因組

泛基因組比單一參考基因組涵蓋了更多的遺傳多樣性。

近年來，科學家已經獲得了多個作物的泛基因組。如何利用這些更為全面的基因組信息培育下一代良種，成為科學家們關心的課題。

台北時間2022年6月8日，《自然》線上發表了中國農業科學院深圳農業基因組研究所黃三文團隊有關泛基因組的兩項研究成果。

以基因組所周姚為第一作者、鮑志貴和張智洋為共同第一作者的論文中，，他們首次獲得了番茄的圖泛基因組，並藉此找回了番茄育種中“丟失的遺傳力”（遺傳力丟失），為解析生物複雜性狀的遺傳機制提供了新思路。論文評審專家法國農業科學研究院研究員Mathilde Causse等認為，“這項工作是對圖泛基因組概念最全面的分析。” “圖泛基因組將可能成為基因組分析和作物基因組育種的標準，在這個意義上，這篇論文是奠基性的（foundational）”。

以唐蝶為第一作者、博士生李宏博和博士後賈玉鑫及中國農科院蔬菜花卉所助理研究員張金喆為共同第一作者的論文中，他們首次解析了二倍體馬鈴薯的泛基因組，研究了茄科茄屬（Genus Solanum）的物種進化，破解了馬鈴薯如何結薯的分子機制，並為雜交馬鈴薯育種改良提供了豐富的遺傳變異信息。《自然》同期發表的瑞典斯德哥爾摩大學生態、環境與植物科學系Juanita Gutiérrez-Valencia和Tanja Slotte的觀點性文章指出，組裝數量如此之多的異交和高雜合馬鈴薯高質量基因組，是一項非凡的成就（remarkable feat）。泛基因組全面鑑定了參與重要生物學過程的基因，能夠賦能馬鈴薯育種。