遺傳力丟失

“遺傳力丟失”是一個經典的數量遺傳學問題,即通過遺傳標記估計的遺傳力以及通過全基因組關聯分析GWAS)發現的所有相關基因所貢獻的遺傳力總和均低於實際的遺傳力。

基本介紹

定義,原理,特點,套用,

定義

調控作物複雜性狀的基因有很多,有些基因的作用明顯,其遺傳力容易被檢測到;而另一些基因的作用比較微弱,這些基因難於檢測到的遺傳力被稱為“丟失的遺傳力”。
找回這些丟失的遺傳力,將有助於理解複雜性狀的遺傳機制。

原理

科學家用“遺傳力”這個概念表示一種作物的性狀受遺傳調控的比例。遺傳力越高,說明性狀的決定過程中遺傳因素占比越大,環境因素占比越小。
在未來的作物育種中,基因組選擇技術將被廣泛套用。當番茄還是幼苗的時候,就對它的基因組進行測序,以此來預測它是否抗病、產量如何、好吃不好吃等。然而,現在的預測還不是很準。
“目前認為遺傳力丟失的主要原因有以下幾個:遺傳標記與真實影響表型基因之間存在著不完全連鎖,導致模型估計產生偏差;稀有等位基因的貢獻不易被察覺;某個基因的不同突變表現出相同的表型使得遺傳分析遺漏;基因與基因的互作和基因與環境的互作增加了分析的複雜性。傳統短片段測序可對長度較小的變異進行鑑定,但對複雜結構變異的檢測能力較差,無法全面評估複雜結構變異對遺傳力的具體影響。”

特點

各個物種都會出現遺傳力丟失的問題,如番茄等。人類中也廣泛存在遺傳力丟失的問題。

套用

台北時間2022年6月8日,《自然》線上發表了中國農業科學院深圳農業基因組研究所黃三文團隊有關泛基因組的兩項研究成果。
以基因組所周姚第一作者鮑志貴張智洋為共同第一作者的論文中,他們首次獲得了番茄圖泛基因組,並藉此找回了番茄育種中“丟失的遺傳力”,為解析生物複雜性狀的遺傳機制提供了新思路。論文評審專家法國農業科學研究院研究員Mathilde Causse等認為,“這項工作是對圖泛基因組概念最全面的分析。” “圖泛基因組將可能成為基因組分析和作物基因組育種的標準,在這個意義上,這篇論文是奠基性的(foundational)”。

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