圖泛基因組

圖泛基因組 (graph pangenome),指藉助數學和計算機中被稱為(graph)的數據結構來展示一個物種所有的基因排列和結構。

基本介紹

  • 中文名:圖泛基因組
  • 外文名:graph pangenome
  • 定義:藉助數學和計算機中被稱為圖的數據結構來展示一個物種所有的基因排列和結構
定義,套用,

定義

圖泛基因組 (graph pangenome)是藉助數學和計算機中被稱為(graph)的數據結構來展示一個物種所有的基因排列和結構。而把一個物種所有的基因都找到,並按照順序排列,就形成了泛基因組(Pan-genome)。

套用

台北時間2022年6月8日,《自然》線上發表了中國農業科學院深圳農業基因組研究所黃三文團隊有關泛基因組的兩項研究成果。
以基因組所周姚第一作者鮑志貴張智洋為共同第一作者的論文中,他們首次獲得了番茄的圖泛基因組,並藉此找回了番茄育種中“丟失的遺傳力”(遺傳力丟失),為解析生物複雜性狀的遺傳機制提供了新思路。論文評審專家法國農業科學研究院研究員Mathilde Causse等認為,“這項工作是對圖泛基因組概念最全面的分析。” “圖泛基因組將可能成為基因組分析和作物基因組育種的標準,在這個意義上,這篇論文是奠基性的(foundational)”。

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