永寧土司是元、明、清三代期間一個摩梭人世襲土司。其轄境為永寧州。土司姓氏為阿姓,治所在今雲南省寧蒗彝族自治縣西北一帶。
永寧土司與麗江土司存在一定血緣關係。早期永寧土司的轄境非常廣大,位於今四川、雲南、西藏交界處。後來永寧土司將木里(今木里藏族自治縣)分封給了一位藏傳佛教喇嘛;1710年,康熙帝將左所、前所之地賜予永寧土司的親戚,此後永寧土司轄境大為縮小。
公元24年,永寧土司的祖先泥月烏來到了永寧。唐朝時臣服於南詔,宋朝時臣服於大理國。忽必烈率蒙古軍隊入侵大理國時,1253年,永寧土司和字歸附。忽必烈留蒙古將領駐守永寧,此後的阿姓土司都自稱是蒙古人的後代。1279年,以其地設永寧州。1279年,設北勝府永寧司。
1381年(洪武十四年)永寧土司卜都各吉至明廷朝見。1406年(永樂四年),明廷以其地設永寧府,隸屬於四川布政使司;卜都各吉的後裔世襲永寧知府之職。1659年,永寧土司歸順清朝,被允許繼續世襲永寧知府之職。
1917年,永寧、蒗蕖兩土司轄地合併,設定寧蒗縣佐,屬永北縣。1956年,永寧土司被廢除。