《水稻組蛋白H3K36甲基化識別和傳遞的分子機制研究》是依託復旦大學,由俞瑜擔任項目負責人的面上項目。
基本介紹
- 中文名:水稻組蛋白H3K36甲基化識別和傳遞的分子機制研究
- 依託單位:復旦大學
- 項目類別:面上項目
- 項目負責人:俞瑜
《水稻組蛋白H3K36甲基化識別和傳遞的分子機制研究》是依託復旦大學,由俞瑜擔任項目負責人的面上項目。
《水稻組蛋白H3K36甲基化識別和傳遞的分子機制研究》是依託復旦大學,由俞瑜擔任項目負責人的面上項目。項目摘要組蛋白修飾是表觀遺傳學研究的核心內容之一。我們實驗室前期的研究報導了一個水稻H3K36甲基轉移酶SDG725,...
《組蛋白修飾(H3K36me3)表觀基因組圖譜的建立及功能研究》是依託杭州師範大學,由於彥春擔任項目負責人的面上項目。項目摘要 組蛋白修飾影響染色質構象進而影響基因表達。組蛋白H3第36位賴氨酸的三甲基化(H3K36me3)在人和酵母高表達基因的外顯子上富集,因而推測其可能影響基因表達或與mRNA的剪接有關。模式...
在組蛋白H3上,共有5個賴氨酸位點可以被甲基化修飾。一般來說,組蛋白H3K4的甲基化主要聚集在活躍轉錄的啟動子區域。組蛋白H3K9的甲基化同基因的轉錄抑制及異染色質有關。EZH2可以甲基化H3K27,導致相關基因的沉默,並且與X-Chromosome inactivation相關。H3K36的甲基化同基因轉錄激活相關。方式 ⒈甲基化 組蛋白甲...
主要研究 1.花粉發育分子生理機制 利用功能蛋白質組和基因組學手段,結合細胞學、生理學等證據探討水稻花粉減數分裂與花粉發育的機制,揭示遺傳和表觀遺傳調控重要的蛋白質的功能。2.種子發育分子生理機制 利用種子突變體,通過遺傳、細胞和生理學研究探討調控種子大小與形狀的分子機制,結合功能蛋白質組分析,揭示相關的...
《組蛋白甲基轉移酶G9a蛋白修飾調控腫瘤生長的分子機制》是依託北京大學,由楊洋擔任負責人的面上項目。項目摘要 功能蛋白質修飾改變的研究是目前生物及醫學研究領域的熱點。組蛋白甲基轉移酶G9a除了可以催化組蛋白H3K9,H3K27,H3K56和H1的甲基化外,近期也檢測到其在多種腫瘤組織樣本中高表達。我們的研究發現,...
1989年,提前獲得加州大學伯克利分校植物生理及分子生物學博士學位,並獲得美國生命科學基金會的博士後獎學金,之後在美國農業部與伯克利分校合辦的研究所里進行博士後研究,研究課題是:擬南芥光形態建成的分子遺傳學分析以及燕麥光敏色素A(phy A)基因的核蛋白與啟動子相互作用的活體DNase指紋分析。1992年初,進入耶魯...
我們利用高通量測序技術對具有不同優勢的雜交組合的親本和子一代不同組織在不同環境條件下進行全基因組基因差異表達分析,並進一步分析造成這種差異表達基於順式作用元件和反式調控因子DNA序列多態性的遺傳機制,以及基於DNA甲基化、組蛋白修飾、染色質重塑和非編碼RNA的表觀遺傳機制,全面探索雜交優勢的可能分子機制。
與DNA密碼不同的是,組蛋白密碼和它的解碼機制在動物、植物和真菌類中是不同的。我們從植物細胞保留有發育成整個植株的全能性和去分化的特性中,就可以看出它們在建立和保持表觀遺傳信息方面與動物是不同的。在組蛋白的修飾中,乙醯化、 甲基化研究最多。乙醯化修飾大多在組蛋白H3的 Lys9、l4、l8、23和H4的Lys...
組蛋白作為DNA纏繞的線軸。 這使得能夠在細胞核內將真核細胞的大型的基因組所必需的壓實物:壓實的分子比未壓實的分子短40,000倍。染色質調控 組織蛋白進行翻譯後修飾,以更改它與DNA及其他核蛋白的相互作用。組織蛋白H3及H4有著核小體伸出的長尾巴,能夠在不同的地方進行共價修飾。這種修飾包括有甲基化、瓜氨化...
2002年,朱健康研究組通過遺傳學的方法第一個克隆了植物體內的去甲基化酶ROS1,並提出在植物中DNA去甲基化是通過ROS1家族介導的鹼基切除修復機制來實現的。2012年6月,朱健康課題組在《科學》雜誌發表的研究揭示了編碼一個組蛋白的乙醯化酶IDM1在植物去甲基化作用機制中的重要作用。2015年1月,朱健康課題組在學術...
5.染色質重塑和基因表達調控的分子生物學 以黃百渠教授為首的研究小組開展了染色質重塑和基因表達調控的分子生物學方面的研究。近年來的研究表明,由核心組蛋白的修飾而引起的核小體和染色質構型改變在轉錄調控中起著關鍵的作用。其中組蛋白乙醯轉移酶/去乙醯化酶(HAT/HDAC)介導的核小體重塑(remodeling)是研究的焦點...
徐國良主要從事動物發育(包括胚胎與成體幹細胞分化)過程中DNA甲基化及組蛋白修飾在基因表達調控中的作用及其分子機理的研究。人物經歷 1981年9月—1985年7月,就讀於杭州大學(現浙江大學)生物系,並獲得學士學位。1985年9月—1989年8月,就讀於中國科學院遺傳與發育生物學研究所,並獲得碩士學位。1989年9月—1993...
《分子細胞生物學(第3版)》是由陳曄光、張傳茂和陳佺主編,高等教育出版社於2019年8月12日出版的教材,是高等院校生命科學及相關學科專業高年級本科生和研究生的教材,也是細胞生物學及相關專業研究人員和高校教師的參考書。全書共分6篇,內容涉及基因表達調控和蛋白質修飾、細胞物質運輸和細胞運動、細胞信號轉導、...
水稻中siRNA主要經DCL4剪下形成,在dcl4RNAi植株中,特異位點的甲基化消失,與愈傷中該位點的情況一致。對活性轉座子位點側翼組蛋白修飾分析結果表明,在愈傷組織中,活性轉座子nDaiZ5-4的組蛋白修飾幾乎消失,而其它沉默轉座子位點的組蛋白修飾水平均比正常植株顯著提高,綜上,我們的研究結果表明DNA轉座子nDaiZ5-...
二、DNA甲基化異常導致基因表達異常 258 三、組蛋白異常修飾 258 四、非編碼RNA引起基因表達改變 259 第四節 翻譯後加工運輸障礙引起的疾病 259 第五節 蛋白質降解異常引起的疾病 260 第六節 病原生物基因引起的疾病 262 第七節 通過結構、表達及功能分析研究疾病分子機制 262 一、基因結構變異分析 262 二、基因...
利用生物化學、遺傳學、結構生物學、生物信息學等方法研究植物生長發育和環境適應過程中的表觀遺傳調控機制。主要包括(1)染色質組裝與重塑調控植物細胞命運和生長發育的分子機制, (2)組蛋白甲基化修飾及其識別調節植物生長發育及環境適應的分子機制。主要成就 代表性成果(*通訊作者)Luo Q, Mo J, Chen H, Hu Z, ...
1. 通過研究組蛋白的甲基化、乙醯化的動態修飾過程了解基因表達調控的作用機制;2. 探索表觀遺傳修飾在各種細胞活動中的作用;3. 了解表觀遺傳修飾與腫瘤發生髮展的關係。4. 蛋白質翻譯後修飾對於神經退行性疾病產生的分子機制。主持課題 1.國家自然科學基金 “調控甲基化酶Set2 及其介導的組蛋白H3K36 甲基化修飾...
近年來的許多研究工作表明染色質(chromatin)的各種共價修飾,如組蛋白修飾(histone modifications)和DNA甲基化修飾,對基因表達的表型遺傳學調控起著重要作用。染色質修飾的多樣性以及對這些修飾的識別為細胞提供了一套遺傳信息的檢索系統。本實驗室致力於利用生物化學手段分離純化與染色質修飾有關的各類蛋白質複合體(...
曹曉風在組蛋白甲基化研究方面,發現植物中首個H3K27去甲基化酶REF6,並提出REF6與LHP1共進化的理論;揭示組蛋白甲基化酶和去甲基化酶調控基因表達和維持轉座子活性的分子機制,首次在基因組水平上證實轉座子具有調控功能;系統研究了擬南芥中蛋白質精氨酸甲基轉移酶的活性和調控開花的遺傳學途徑,發現AtPRMT5和At...
俞瑜,復旦大學生命科學學院生物化學系工作,從事植物表觀遺傳修飾調控的研究,研究方向是植物組蛋白的修飾與識別。研究方向 主要從事植物表觀遺傳修飾調控的研究,主要研究方向是利用生物化學、分子生物學、細胞生物學和遺傳學等多種手段研究植物組蛋白賴氨酸甲基化修飾與識別調控基因表達和植物生長發育的分子機制。人物簡介...
組蛋白修飾對基因表達與沉默發揮重要調控作用,在早期胚胎髮育過程中, 異常的組蛋白修飾會導致胚胎髮育停滯。哺乳動物植入前胚胎全基因組水平組蛋白修飾的建立與調控是發育生物學領域一個亟待解決的科學問題。同濟大學高紹榮團隊首次利用微量細胞染色體免疫共沉澱技術揭示了H3K4me3和H3K27me3兩種重要組蛋白修飾在早期胚胎中的...
5.3 X染色體失活的動物模型與分子機制 84 5.4 X染色體失活與人類疾病 89 5.5 總結與展望 92 參考文獻 93 第6章 組蛋白甲基化修飾 100 6.1 蛋白質甲基化研究小史 100 6.2 組蛋白甲基化酶的種類及催化的修飾類型 101 參考文獻 111 第7章 組蛋白去甲基化 117 7.1 組蛋白去甲基化...
2015年10月29日,徐彥輝課題組在《Nature》雜誌線上發表了題為“Structural insight into substrate preference for TET-mediated oxidation”(晶體結構揭示TET蛋白介導的氧化反應底物偏好性機制)的研究論文,首次報導了TET蛋白對三種DNA甲基化衍生物不同催化活性的分子機制,為基因組中5-羥甲基胞嘧啶相對穩定存在提供了...
高紹榮帶領團隊利用微量細胞ChIP-Seq技術,首次揭示了小鼠植入前胚胎髮育中的組蛋白H3K4me3和HK27me3修飾建立模式,入選2016年中國生命科學十大進展;進一步闡明小鼠和人早期胚胎髮育中異染色質相關H3K9me3修飾的建立及調控轉座原件的分子機制,及其與DNA甲基化的互作和對基因印跡的調控,極大拓展了表觀遺傳對早期胚胎髮育...
研究首次表明AF9通過識別組蛋白H3K9乙醯化修飾,促進了組蛋白H3K79甲基化的共沉積和基因活化,揭示出一種新型組蛋白修飾交叉會話機制,體現了真核生物表觀遺傳調控的複雜和精密性。專家表示,這項研究成果不僅揭示了組蛋白乙醯化調控和人類疾病與健康的關係,也為後續YEATS結構域靶向的小分子藥物開發奠定了基礎。
真核生物的DNA不是單獨存在的,而是纏繞在四種組蛋白分子上構成染色質。研究表明,表觀遺傳變異是通過對染色質(包括DNA和組蛋白)的共價化學修飾而實現的。具體來說,表觀遺傳變異包括DNA甲基化、組蛋白修飾的改變、染色質重塑以及非編碼RNA豐度的變化等。對於同卵雙胞胎而言,二者在成長的過程中不可能處在完成相同的...
以後的研究證明,這種朊粒不是病毒,而是不含核酸的蛋白質顆粒。一個不含DNA或RNA的蛋白質分子能在受感染的宿主細胞內產生與自身相同的分子,且實現相同的生物學功能,即引起相同的疾病,這意味著這種蛋白質分子也是負載和傳遞遺傳信息的物質。這是從根本上動搖了遺傳學的基礎。實驗證明,朊粒確實是不含DNA和RNA的...
一級結構與功能的關係:原核生物mRNA一般5'端有一段不翻譯區,稱前導順序,3'端有一段不翻譯區,中間是蛋白質的編碼區,一般編碼幾種蛋白質。如大腸桿菌乳糖操縱子mRNA編碼3條多肽鏈;色氨酸操縱子mRNA編碼5條多肽鏈。也有單順反子形式的細菌mRNA,如大腸桿菌脂蛋白mRNA。原核生物mRNA分子中一般沒有修飾核苷酸,...