櫛孔扇貝細胞遺傳學圖譜構建

《櫛孔扇貝細胞遺傳學圖譜構建》是依託中國海洋大學,由黃曉婷擔任項目負責人的青年科學基金項目。

基本介紹

  • 中文名:櫛孔扇貝細胞遺傳學圖譜構建
  • 項目類別:青年科學基金項目
  • 項目負責人:黃曉婷
  • 依託單位:中國海洋大學
中文摘要,結題摘要,

中文摘要

細胞遺傳學圖反映DNA標記或基因在染色體上實際的櫻盼付物理位置,揭示基因與分子標記間的真實連鎖關係,為基因工程育種提供理論依據。本研究結合櫛孔扇貝已有的基因組學研究基礎,套用螢光原位雜交技術(FISH),從四個方面開展細胞遺傳學圖構建工作: a.篩選包含轉座子、衛星、小衛星等重複序列的Fosmid克隆,將這些重複序列定位到染色體上,分析櫛影嫌墓孔扇貝基因組中重複序列在染色體上的分布特徵;b.將遺傳連鎖圖譜上的SSR標記定位到染色體上,為櫛孔扇貝遺傳連鎖圖譜與物理圖譜的整合奠定基礎;c.將與生長、抗逆相關的跨騙尋功能基因定位到染色體上,為研究基因網路提供細胞遺傳學證據;d.繪製櫛孔扇貝細胞遺傳學圖譜,實現櫛孔扇貝單條染色體的識別鑑定。研究結果將豐富扇貝細胞遺傳學研究內容,有助婆充於了解功能基因、分子標記、重複序列的連鎖關係及進一步的遺傳育種套用。

結題摘要

細胞遺傳學圖反映DNA標記或基因在染色體上實際的物理位置,揭示基因與分子標記間的真實連鎖關係,為基因工程育種提供理論依據。經過3年的研究工作,課題組取得以下重要成果:1) 建立了貝類多色多重螢光原位雜交技術(M-FISH),繪製出第和店鞏擊一張櫛孔扇貝細胞遺傳學圖譜,圖譜共包含61個位點,包括5個功能基因、32個SSR標記、8個重複序列以及16個包含未知序列的BAC克隆,實現了捆嚷催櫛孔扇貝19條染色體的區分鑑定; 2) 將遺傳連鎖圖譜上的SSR標記(包含與重要經濟性狀相關的QTL)64個標記進行染色體殼格恥乎定位,有40個位點成功定位到櫛孔扇貝的染色體上,實現了遺傳連鎖圖譜與細胞學圖譜的初步整合,定位結果顯示SSR標記在染色體的位置與其在連鎖圖上的位置存在一定的偏差,研究結果遺傳圖譜與物理圖譜的整合提供了依據;3) 將包含重複序列的28個fosmid克隆進行染色體定位,發現櫛孔扇貝重複序列主要分布於染色體的端部位置,其次是著絲粒位置,少數定位在染色體臂的中間位置;4)定位了16個包含生長、發育、抗逆相關功能基因的Fosmid、BAC克隆,獲得了這些基因在染色體上的位置。研究結果為扇貝基因組學、基因網路以及進化研究提供了重要依據。

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