扇貝比較細胞遺傳學研究

《扇貝比較細胞遺傳學研究》是依託中國海洋大學，由黃曉婷擔任項目負責人的面上項目。

基本介紹

• 中文名：扇貝比較細胞遺傳學研究
• 項目類別：面上項目
• 項目負責人：黃曉婷
• 依託單位：中國海洋大學

中文摘要

扇貝科大約有400個現存種，它們的染色體數目和形態差異顯著，是研究染色體進化的好材料。項目組在前期工作的基礎上，擬開展以下研究：篩查櫛孔扇貝和蝦夷扇貝高密度遺傳連鎖圖譜上與性狀相關的標記，以及連鎖程度較高、難於確定位置關係的標記進行染色體定位，對高密度遺傳連鎖圖譜進行驗證和補充；將重複序列、SNP標記以及功能基因定位到蝦夷扇貝染色體上，繪製蝦夷扇貝細胞遺傳學圖譜，實現蝦夷扇貝單條染色體的識別鑑定；篩查櫛孔扇貝和蝦夷扇貝高密度遺傳連鎖圖譜上的共享標記，比較兩種扇貝的表達譜數據獲得共享的基因信息，以及通過全基因組水平系統發生研究獲得的共享標籤，將這些位點進行染色體定位，討論扇貝科物種染色體的進化過程。研究結果不僅可以為扇貝遺傳育種提供重要的理論依據，也可以為扇貝科系統發生研究提供重要的細胞遺傳學證據。

結題摘要

扇貝科大約有400 個現存種，它們的染色體數目和形態差異顯著，是研究染色體進化的好材料。課題組經過4年的研究工作，取得以下研究成果：（1）完成櫛孔扇貝與蝦夷扇貝高密度遺傳連鎖圖譜的驗證。將櫛孔扇貝30個包含連鎖圖譜上標記的BAC克隆進行了染色體定位，結果證明已有的連鎖圖譜中8個連鎖群上的兩個標記位於同一染色體上，4個連鎖群中的標記被定位於不同染色體上，連鎖群 LG16和 LG6、連鎖群LG 18和LG8應連線到一起，3個連鎖群長度不完整，對5個連鎖群方向進行校正；對蝦夷扇貝58個SNP-fosmid克隆進行染色體定位，發現已構建的高密度遺傳連鎖圖譜中7個連鎖群上標記在染色體上的位置與其在連鎖群上的位置一致，3個連鎖群應當進一步劃分，6個連鎖群不完整，對4個連鎖群方向進行校正；（2）對蝦夷扇貝基因組中重複序列進行了分析，篩選出25個串聯重複序列、22個功能基因和87個高密度圖譜上的SNP標記進行染色體定位，通過單雜交和多輪共雜交，最終共獲得76個標記在染色體上準確的位置關係，繪製出蝦夷扇貝染色體圖譜，圖譜共包含58個標記，染色體上標記數目為2-7個，可以實現蝦夷扇貝19對染色體的區別鑑定；（3）根據對ITS和5SrDNA在5種扇貝中的定位結果，結合已有的扇貝核型數據，推測櫛孔扇貝的進化地位是最古老的，蝦夷扇貝和海灣扇貝的兩個ITS位點可能是進化過程中發生DNA片段複製產生的，比較有趣的華貴櫛孔扇貝的長中部著絲粒染色體是由羅伯遜易位進化而來，而紫扇貝在進化過程中ITS位點發生了大量的複製易位現象，是比較新的扇貝種類。研究結果豐富了扇貝細胞遺傳學研究結果，同時對扇貝基因組學及進化研究提供重要的細胞遺傳學證據。