昌吉回族自治州生態環境局是昌吉回族自治州人民政府工作部門。
主要職責,領導信息,
主要職責
（一）落實國家環境保護基本制度。貫徹執行國家、自治區環境保護政策、法律法規、規劃，擬訂並組織實施自治州環境保護規劃，起草環境保護單行條例；組織編制環境功能區劃、生態功能區劃；組織擬訂重要飲用水水源地、重點區域、流域及專項污染防治規劃並監督實施。
（二）負責重大環境問題的統籌協調和監督管理。組織協調重大環境污染事故和生態破壞事件的調查處理，指導協調重大突發環境事件的應急、預警工作；協調解決有關跨區域環境污染糾紛，統籌協調自治州流域、區域污染防治工作。
（三）承擔落實自治區和自治州減排目標的責任。執行國家主要污染物排放總量控制和排污許可證制度，按照自治區減排目標制定自治州總量控制計畫並組織實施，督查、督辦、核查各縣市污染物減排任務完成情況；實施環境保護目標責任制、總量減排考核並公布考核結果。
（四）承擔從源頭上預防、控制環境污染和環境破壞的責任。組織實施自治州規劃與建設項目環境影響評價、環保“三同時”等環境管理制度；對自治州涉及環境保護的條例草案提出有關環境保護方面的意見；按照國家和自治區規定審批建設項目環境影響評價檔案。
（五）負責環境污染防治的監督管理。監督管理水體、大氣、土壤、噪聲、光、惡臭、固體廢物、有毒有害化學品、機動車等的污染防治；會同有關部門監督管理飲用水水源地環境保護工作；組織指導城鎮和農村的環境綜合整治工作；組織排污申報登記制度實施。
（六）指導、協調、監督生態保護工作。擬訂生態保護規劃，組織評估生態環境質量狀況，監督對生態環境有影響的自然資源開發利用活動、重要生態環境建設和生態破壞恢復工作；指導、協調、監督各種類型的自然保護區、風景名勝區、森林公園環境保護工作；協調和監督野生動植物保護、濕地環境保護、荒漠化防治工作；協調指導農村環境保護；監督生物技術環境安全；組織協調生物多樣性保護。
（七）負責核安全和輻射安全的監督管理。參與輻射環境事故應急處理工作；監督管理放射源安全；監督管理核技術套用、電磁輻射、伴有放射性礦產資源開發利用中的污染防治。
（八）負責環境監測和信息發布。監督執行環境監測制度和規範，組織實施環境質量監測和污染源監督性監測；組織對環境質量狀況進行調查評估、預測預警；編制自治州年度環境質量報告書；管理全州環境統計、環境信息;組織建設和管理自治州環境監測網、環境信息網工作；建立和實行環境質量公告制度，負責發布自治州環境綜合性報告和重大環境信息。
（九）開展環境保護科技工作。執行國家及自治區環境保護技術政策，組織擬訂自治州環境保護科技規劃與計畫；組織自治州重大環境科技研究及環境科技活動；參與指導和推動循環經濟和環保產業發展工作。
（十）組織、指導和協調環境保護宣傳教育工作。制定並組織實施環境保護宣傳教育規劃，開展生態文明建設和環境友好型社會建設的有關宣傳教育工作，推動社會公眾和社會組織參與環境保護。
（十一）指導自治州環境保護隊伍建設；規劃與組織指導全州環保系統在職人員崗位培訓。
（十二）承擔自治州人民政府交辦的其他事項。
領導信息
馬雁斌：局長
李昭江： 黨組書記、副局長
馬雁斌：黨組副書記、副局長
趙雪輝： 黨組成員，副局長
尤建文： 黨組成員、紀檢組長
