控制區又稱D-環區，位於tRNA-Pro和tRNA-Phe之間，是整個線粒體基因組序列和長度變異最大的區域，屬非編碼區。由於其機構和進化上的特點，mtDNA在系統發育、演化及遺傳多樣性等方面得到了廣泛的套用。
mtDNA控制區序列(D-loop)以其較高的突變積累對於研究物種種內的遺傳分化具有重要價值
控制區
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