《微生物功能基因組學及病原細菌的致病機制研究》是吉林大學出版的圖書，作者是林金水
《微生物功能基因組學及病原細菌的致病機制研究》是吉林大學出版的圖書，作者是林金水內容簡介本書很好地整合了微生物功能基因組學的知識要 點，如基因組學概述、如何利用基因組數據、基因功 能預測的技術方法、DNA微陣...
這項研究是從對微生物完整的全基因核苷酸測序入手，在分析基因結構的基礎上，認識微生物的完整生物學功能。 微生物基因組研究具有目標明確、相對投入少、收效快、成果易於轉化為產品等許多優點。大多數微生物基因組已被國外學者報導，或正在測序，但還有一些我國特有的微生物資源，如投入力量進行基因組研究，有可能很快...
11.2大腸桿菌：模式真細菌 11.3枯草芽孢桿菌（Bacillussubtilis）：革蘭陽性菌的典範 11.4釀酒酵母：高等真核生物的模型 11.5模式真核生物的比較基因組學 11.6總結 推薦讀物 第12章病原菌與環境中重要微生物的功能基因組分析 12.1引言 12.2通過基因組序列與功能注釋研究細菌的致病機理 12.3比較基因組學：研究...
《口腔微生物代謝功能與牙周病致病機制的關係研究》是依託北京大學，由張翼飛擔任負責人的青年科學基金項目。項目摘要 牙周病是發生在牙周支持組織的菌斑相關性疾病，之前的研究認為菌群失調是發生牙周病的根本原因，但這一疾病的發病機制尚未得到徹底的認識。由於口腔微生物與口腔環境之間是相互作用相互影響的關係，因此，...
《病原菌基因表達和抗藥性受抗生素調節的基因組學研究》是依託西北大學，由段康民擔任項目負責人的面上項目。項目摘要 面對不斷出現的新病原體以及病原體的抗藥性，研究病原體的致病機理和耐藥性機制是當前微生物學的重要課題。抗生素除殺菌或抑菌外，低於抑制濃度的抗生素可以調節致病因子基因的表達，誘導病原菌...
鑑定宿主與PPE38蛋白相互作用的受體；研究PPE38引發的下游信號通路，闡明引起炎性因子分泌和細胞壞死的分子機制；利用基因晶片技術篩選與肉芽腫形成及維持相關基因及其調控網路，通過斑馬魚基因敲除技術驗證關鍵基因的功能，明確其維持肉芽腫結構的分子機制。本研究成果將有助於闡明PE/PPE家族蛋白在分枝桿菌致病中的重要作用...
細菌基因組學是研究細菌全基因組DNA 序列及其結構與功能的學科。1995 年, 科學家獲得了流感嗜血桿菌(Haemophilus influenzae Rd)的全基因組序列, 這是第一個完整的基因組序列, 也是第一個完成的細菌基因組序列。緊接著古細菌詹氏甲烷球菌(Methanococcus jannaschii)基因組、大腸桿菌(Escherichiacoli K-12)基因組等也...
TargetP等資料庫完成功能基因、代謝通路、分泌蛋白等注釋；進而圍繞病原細菌的致病過程，在基因組水平上篩選侵染線蟲的毒力因子以及重要次生代謝產物的合成基因；通過與非致病近源種屬的比較基因組學分析，揭示線蟲病原細菌B. nematocida 16基因組適應於侵染線蟲的基因獲得與丟失，並在基因組水平上構建了影響病原致病過程...
本書共分個章，前四章扼要介紹了細菌的結構、新發和復發細菌性病原體、可能作為生物恐怖的病原菌及其防治措施、抗菌藥物及耐藥性；後六章重點突出病原細菌研究中的前沿領域，主要涉及病原細菌的基因組學、細菌的分泌系統、致病細菌的分子診斷技術、研究致病菌基因功能的新方法、細菌性疫苗的新策略等。內容豐富、新穎...
本研究擬利用基因組學、轉錄組學、蛋白組學和、生物信息學等方法探討優勢亞型特有遺傳突變及其導致的基因調控網路改變與高致病性的關係，闡明其在進化過程中產生高致病性的生物學機制。本研究成果將豐富和完善微進化過程中多基因相互作用機制的理論；揭示結核菌進化中的關鍵遺傳變異所調控的網路功能，為新藥和疫苗的研發...
（2）獲得了IHF突變體和野生菌EC1的轉錄組學，突變體與野生菌EC1基因組轉錄表達中，共有1080個基因表達差異，其中下調的基因442個，上調的基因638個，涉及細菌的分泌系統、蛋白質、胺基酸、脂肪酸組成與代謝，細胞結構、組分、細胞生物功能等諸多方面。 （3）明確了IHF綜合調控水稻基腐病菌的運動性、生物膜...
大量研究報導rel基因與細菌毒力因子表達的調控密切相關，推測IPAV株毒力減弱與該基因突變有關。本項目在此基礎上，擬對rel基因的功能進行深入研究，以闡明rel基因在鉤體致病中所起的作用。目前rel基因在鉤體中的功能未有研究報導，故本研究有較高創新性和學術價值。結題摘要 細菌通過產生鳥苷四磷酸（ppGpp）或鳥苷...
. 本項目以病原真菌煙麴黴及其近緣種為研究對象，建立轉錄組資料庫，篩選溫度適應性關鍵基因；從微進化的角度，利用比較基因組學、表觀遺傳學等研究手段，圍繞與溫度適應性相關的關鍵基因的種類、作用方式和調控途徑等，分析其基因功能及表觀遺傳修飾作用，揭示真菌溫度適應性的本質，探討其與致病的關係。為真菌感染...
我們實驗室首次報導DF是3-羥基苯甲酸，在此基礎上，本項目以野油菜黃單胞菌為模式菌株，從生物學和化學兩個角度，(1)深入研究功能未知的DF合成相關蛋白XanB2的生化功能、酶促催化活性和催化機理；(2)通過全基因組突變分析、比較基因組分析和莽草酸途徑基因敲除等方法，建立完整的DF生物合成途徑；（3）通過C13標記...
《鼠疫耶爾森氏菌調節小RNA的篩選、鑑定和初步功能驗證》是依託中國人民解放軍軍事科學院軍事醫學研究院，由韓延平擔任項目負責人的面上項目。中文摘要 調節小RNA指那些不編碼蛋白質即可調節基因表達或蛋白質活性的一類RNA，其廣泛存在於生物體中，參與多種細胞生理過程。對於病原細菌基因組小RNA的鑑定將有助於圈定...
我們綜合運用基因組學、代謝組學和生物信息學技術，研究腸道微生物組（microbiome）或腸道細菌及其效應蛋白和代謝產物與炎症和癌症等的發生、發展的關聯性及其分子機制；同時，運用合成生物學的相關策略，建立重要腸道菌的分子遺傳作業系統，以期實現對腸道細菌功能的精準調控。講授課程 1. 主講本科生課程：必修課“生物...
主要研究方向 1．耐藥結核分枝桿菌的分子流行病學和耐藥機制研究 2．人腸道菌群的元基因組學研究以及人腸道病原菌的分離、鑑定，及其耐藥和致病機制研究 所獲榮譽 2021年12月，中國科學院病原微生物與免疫學重點實驗室被全國科技系統抗擊新冠肺炎疫情表彰工作領導小組辦公室擬表彰為“ 全國科技系統抗擊新冠肺炎疫情先進...
我們通過一系列實驗發現多個細菌小RNA及其相關應激條件（包膜刺激、營養條件、二甲亞碸）能改變細菌生長特性或特定致病因子（三型分泌系統、H7鞭毛、耐藥性、Curli菌毛）表達水平；而且小RNA可以通過與三型分泌系統毒力島上基因的mRNA靶點配對結合，對毒力基因的表達進行精細的瞬時調控。本項目中，我們獲得了一系列應激...
Tringe所指的"群落"即是微生物群落及其生活的環境。例如，在蘋果園裡，Handelsman可以研究一些土壤作物中的微生物群落，瓦解細胞壁和細胞膜，融合不同細菌的基因組並分析其功能，以檢驗用於蘋果樹的抗生素以探明基因是否使抗生素失效。這項研究有助於果園主知道他們使用抗生素的成效，並使研究人員鑑定抗藥性相關的基因。由...
通過序列分析，我們發現YopM具有與志賀氏菌三型分泌系統IpaH 家族相比具有相似的序列。通過體外泛素化實驗，我們發現YopM與已知的IpaH家族一樣具有E3連線酶的功能。其中，位於N端CLD結構域是其發揮E3連線酶功能的重要的結構域。炎症反應是宿主抵禦病原微生物感染的重要機制。當炎症反應發生時，能分泌各種細胞因子以及...
