專用基金審計是對企業各項專用基金的形成和使用實施情況進行審核、稽查。其主要內容有：(1) 檢查各項專用基金形成、提存的合法性，是否按照國家規定的標準，基金形成的條件和比例提取，是否擅自提高提取比例。(2) 檢查各專用基金使用的適當性，是否貫徹專款專用原則，檢查企業對各項專用基金是否堅持先提後用，量入為出的原則，是否按照規定的使用範圍開支。(3) 檢查各項專用基金增減變化的會計處理的正確性，對專用基金與生產流動資金之間發生必要的相互墊付情況，是否及時辦理結算手續，有無長期拖欠現象。
專用基金亦稱“專用資金”。企業按規定從產品成本和企業留用利潤中提取的各種具有專門用途的資金。國營企業的專用基金包括：更新改造基金、大修理基金、新產品試製基金、生產發展基金、後備基金和保險基金。其來源，主要由企業根據規定自行提取。企業對專用基金的使用應貫徹專款專用原則，並先提後用。專用基金是企業專項資金的主要資金來源。專用基金的形成和使用情況，通過“專用基金”帳戶核算。形成專用基金時，貸記該帳戶，使用專用基金時，借記該帳戶，期末貸方餘額表示專用基金的結存數。在“專用基金”總分類帳戶下，應設定“更新改造基金”、“大修理基金”、“新產品試製基金”、“生產發展基金”、“後備基金”和“風險保證金”等明細分類帳戶，組織明細分類核算。
