宏基因組測序與分析是河北大學建設的虛擬仿真實驗課程。
宏基因組測序與分析是河北大學建設的虛擬仿真實驗課程。課程簡介微生物是自然界中分布最廣、種類最多、數量最大的生物類群，然而自然界中絕大多數的微生物不能通過傳統方法進行純培養，因而開展依賴於純培養的生物技術識別微生物多樣性難...
宏基因組學(或元基因組學，metagenomics)是一種以環境樣品中的微生物群體基因組為研究對象，以功能基因篩選和/或測序分析為研究手段，以微生物多樣性、種群結構、進化關係、功能活性、相互協作關係及與環境之間的關係為研究目的的新的微...
宏基因組測序是研究宏基因組的群落結構的一種高通量技術。通常，宏基因組測序數據中包含了成百上千種微生物和病毒的DNA序列。數據分析的困難主要有三點，首先是異質性程度高，數據中混合的微生物和病毒的數目事先未知，其次是近源物種...
《空氣中病原微生物宏基因組測序鑑定方法》是2024年7月1日開始實施的一項中國國家標準。編制進程 2023年12月28日，《空氣中病原微生物宏基因組測序鑑定方法》發布。2024年7月1日，《空氣中病原微生物宏基因組測序鑑定方法》實施。起草...
新一代高通量低成本測序技術的廣泛套用，科學家們可以對環境中的全基因組進行測序，在獲得海量的數據後，全面地分析微生物群落結構以及基因功能組成等。短短几年來，宏基因組學的研究已經滲透到各個領域，從海洋到陸地，再到空氣，從...
基因組學主要研究基因組的結構、功能、進化、定位和編輯等，以及它們對生物體的影響。簡介 基因組學的目的是對一個生物體所有基因進行集體表征和量化，並研究它們之間的相互關係及對生物體的影響。基因組學還包括基因組測序和分析，通過...
明確聚磷菌的種群結構及數量變化特點，為深入了解聚磷菌在水體磷循環及富營養化中的作用機理奠定基礎；利用宏基因組測序技術探索這兩個樣品中微生物的群落特徵，結合對磷及其他理化條件的分析，探索微生物種群組成的變化與藻華爆發的關係...
本項目選用我國與非洲尚比亞生物冶金工業浸出體系為研究對象，採用宏基因組測序技術全面分析兩地浸礦微生物的種群與遺傳多樣性及其差異，結合環境與工藝礦物學分析，進一步了解多樣性差異的原因。同時，通過浸礦微生物群落的交換移植和群落潛入...
·基因組De novo測序 · 轉錄組測序 ·全基因組重測序 ·宏基因組測序 ·小RNA測序 TBC服務承諾 1， 測序平均讀長承諾50bp，每基因組測序量達100倍以上;2， 全基因組精細圖達到全基因組少於100個contigs，基因組覆蓋度大於95%，...
針對太湖個別季節和時間段水體中藍藻群體顆粒較少，較難收集足夠樣本以滿足測序建庫對DNA濃度和總量要求的情況，我們擬結合單細胞擴增的方法，進行太湖水華暴發全過程的藍藻群體顆粒附生細菌的宏基因組學跟蹤調查。同時結合二代和三代測序方法...
宏基因組學是近年來新興起的一個概念，它是通過序列篩選和功能篩選兩種方法對微生態環境中所有微生物的組成和一些功能基因進行測序分析和篩選研究。我們的研究是通過454焦磷酸測序的方法對不一致齲表型的雙胞胎兒童的牙菌斑進行高通量測序，...
項目研究內容包括：（1）基於宏基因組測序分析了鹹鰳魚醃製期間微生物菌群結構組成及其變化趨勢，明確了不同醃製階段優勢微生物菌群總體變化規律，發現在不去除內臟、魚鰓的傳統醃製工藝生產中，魚體攜帶假單胞菌、弧菌、嗜冷桿菌以及希瓦氏...
來自華大基因的中國科學家將會負責EMP亞洲地區所有樣本的收集和鑑定，並對整個項目提供DNA提取、擴增、建庫、宏基因組測序以及研發生物信息學分析流程所需的計算資源。這些信息學分析流程將為EMP產生的大量數據提供一個分析框架。地球上的微...
在此基礎上，本申請擬以食管微生物基因組與癌變基因組交叉分析為突破口，擬對食管癌變過程中的內鏡標本（正常-非典型增生-浸潤癌）進行16S rDNA與宏基因組測序對微生物進一步細化與分群，在兩套基因組功能分析的基礎上將癌變與微生物感染...
我們著重考慮基因簇較小的目標，比如雷帕黴素類生物合成基因。目前已獲得超過30個含有色氨酸鹵化酶基因的陽性克隆，插入片段為30-45kb。後續工作將根據末端測序結果挑選個別單克隆做插入片段全測序。測序後將根據分析結果做相應基因操作。
致力於發展新的計算生物學方法並運用於宏基因組分析，闡明極端微生物微進化過程和機制的若干關鍵問題。主要研究內容為：以極端環境下的微生物群落為研究對象，基於當前高通量測序技術獲得的宏基因組數據，圍繞極端微生物基因組微進化的主題，...
2.5測序質量標準為Q30（即每個鹼基的準確度為99.9％），並且75%以上的鹼基比例達到Q30；。主要功能 小型全基因組測序（微生物/病毒） 靶向基因測序（擴增子、基因集合） 16S宏基因組測序。
宏基因組測序對環境樣本所有微生物基因組DNA進行提取和高通量測序，分析樣本環境中所有微生物基因組信息。宏基因組測序解讀微生物群體的多樣性與豐度信息，分析微生物群體基因組及功能，也探求微生物與環境、微生物與宿主之間的關係，發掘和...
廣東省標準化過敏原工程技術研究中心圍繞著過敏性疾病過敏原和發病機制的基礎研究，以及過敏性疾病預防、診斷和治療性疫苗的研究。研究方向 方向一、利用宏基因組測序技術，分析塵蟎等吸入過敏原的全基因組；並探討過敏性哮喘等過敏疾病的...
本課題收集28例健康人及28例慢性肝衰竭患者的糞便樣本，進行宏基因組小片段建庫、測序及生物信息學分析。宏基因組測序共產生了252G的測序數據，平均每個樣品產生4.49 GB的數據，建立了第一個慢性肝衰竭患者的基因集，共包含596,075個...
然而，新近發展起來的大規模，高通量的宏基因組學技術，包括GeoChip功能基因晶片，使得從特定時空分析微生物群落成為可能。有了這些新工具，生態學家將不在因為手頭上只有少量數據而需要回答一個生態學問題而泄氣了。大規模宏基因組學測序...
