核心技術
“DNA簇”和“可逆性末端終結”實現自動化樣本製備及
基因組數百萬個
鹼基平行測序。
測序原理
Solexa 方法是利用單分子陣列測試 genotyping ,此種測序法首先是將 DNA 從細胞中提取,然後將其打斷到約 100 - 200bp 大小,再將接頭連線到片段上,經 PCR 擴增後製成 Library 。隨後在含有接頭的晶片( flow cell )上將已加入接頭的 DNA 片段綁定在 flow cell 上,經反應,將不同片段擴增。在下一步反應中,四種螢光標記的染料套用邊合成邊測序( Sequencing By Synthesis )的原理,在每個循環過程里,螢光標記的核苷和聚合酶被加入到單分子陣列中。互補的核苷和核苷酸片斷的第一個
鹼基配對,通過酶加入到引物上。多餘的核苷被移走。這樣每個單鏈 DNA 分子通過
互補鹼基的配對被延伸,利用
生物發光蛋白,比如
螢火蟲的
螢光素酶,可通過
鹼基加到引物後端時所釋放出的
焦磷酸鹽來提供檢測信號。針對每種鹼基的特定波長的雷射激髮結合上的核苷的標記,這個標記會釋放出螢光。螢光信號被 CCD 採集,CCD 快速掃描整個陣列檢測特定的結合到每個片斷上的鹼基。通過上述的結合,檢測可以重複幾十個循環,這樣就有可能決定核苷酸片斷中的幾十個鹼基。
Solexa測序技術第二代分析系統Genome Analyzer IIx是當前世界上套用最為廣泛的新一代測序系統,較當前普遍使用的一次只能讀取1,000個左右的鹼基,且DNA樣品需要長時間的製備和分析的測序儀,具有高準確性、高通量、高靈敏度和低運行成本等突出優勢。可以同時完成傳統基因組學研究以及
功能基因組學研究。為目前遺傳分析和
功能基因組等研究領域提出了全新的套用方案。
Genome Analyzer IIx測序讀長為75×2 bp,每次運行數據量達14~18GB。對於4~5Mb的基因組,可確保每個基因組測序量達到400Mb(~100X覆蓋),足以滿足全基因組de novo測序和SNP鑑定的需要。
TBC已購置亞太地區第一台GA IIx測序儀,基於十餘年基因組學研究經驗及強大的生物信息學綜合技術平台支持,為客戶提供從制定研究計畫到獲得研究成果的全面解決方案。
TBC服務內容
·基因組De novo測序
· 轉錄組測序
·全基因組重測序
·宏基因組測序
·小RNA測序
TBC服務承諾
1, 測序平均讀長承諾50bp,每基因組測序量達100倍以上;
2, 全基因組精細圖達到全基因組少於100個contigs,基因組覆蓋度大於95%,基因區覆蓋度達到98%以上,單
鹼基錯誤率低於十萬分之一;
3, 完成圖得到完整全基因組序列,無片段錯拼和遺漏,單鹼基錯誤率低於十萬分之一;
4, 超高通量、高效率、高重複性、高準確率、低成本、完備的生物信息學分析和輔助研究,確保客戶從研究計畫到得到研究成果全過程的順利進行。