《基因組學：核心實驗方法》是在2012年3月科學出版社出版的圖書。本書主要闡述了基因組學及其衍生學科的各種關鍵技術。
基本介紹
- 書名：基因組學：核心實驗方法
- 出版社：科學出版社
- 出版時間：2012年3月
- 開本：16開
基本信息,內容簡介,目錄,
基本信息
書名：基因組學：核心實驗方法
編著：[英]Mike Starkey, [英]Ramnath Elaswarapu 著；于軍 主譯
出版：科學出版社 2012年3月出版
語種：中文
標準書號：978-7-03-033378-0
裝幀：平裝
版本：第一版
開本：16開
責任編輯：羅靜,劉晶
字數：425千字
頁數：291
書類：理論專著/研究生教育
編輯部：生物出版分社
內容簡介
本書主要闡述了基因組學及其衍生學科的各種關鍵技術，涉及內容廣泛，涵蓋實驗手段和計算機模擬等方法。尤其是其中的實驗方法，都是依據專家撰寫的實驗報告而建立的，並來自於實驗室里套用新技術進行研究的第一線數據。特點是實用性強、可靠性強、專業指導性強，非常適合於從事基因組學及其在生命科學領域的各個衍生學科研究的研究生和青年學者閱讀。讀者不僅可以在這裡了解到實驗技術的詳細步驟，還可以掌握實驗技術的根本思想和原理，有助於進一步提出其他的替代方法。
目錄
《新生物學叢書》叢書序
譯者前言
前言
1 基因拷貝數量變化的高精度分析
1.1 簡介
1.2 方法和途徑
1.2.1 寡核苷酸比較基因組雜交(aCGH)晶片
1.2.2 單核苷酸多態性比較基因組雜交(aCGH)晶片
1.2.3 多重連線探針擴增
1.3 疑難解答
參考文獻
2 遺傳圖譜中的多態性標記識別
2.1 簡介
2.2 方法和途徑
2.2.1 基因變異的知識庫
2.2.2 基因變異的靶向重測序
2.3 疑難解答
2.3.1 引物設計
2.3.2 PCR擴增
2.3.3 二進制檔案的使用
2.3.4 Phred/Phrap軟體
參考文獻
3 基於SNP晶片的基因分型和雜合性缺失分析
3.1 簡介
3.2 方法和途徑
3.2.1 晶片
3.2.2 基因分型
3.2.3 連鎖關聯分析
3.2.4 甲醛固定石蠟包埋組織
3.2.5 雜合性缺失
3.3 疑難解答
參考文獻
4 複雜性狀的基因定位
4.1 簡介
4.2 方法和途徑
4.2.1 關聯分析方法：隨機樣本
4.2.2 關聯方法：基於家系樣本
4.2.3 連鎖分析：使用LOD值作為參數的分析方法
4.2.4 連鎖分析：非參數方法
4.2.5 總結
4.3 疑難解答
4.3.1 合併數據集
參考文獻
5 針對單細胞敏感性的RNA擴增技術
5.1 簡介
5.1.1 RNA擴增的目的
5.1.2 擴增的方法
5.2 方法和途徑
5.2.1 T7RNA聚合酶的體外轉錄
5.2.2 全局RT-PCR
5.3 疑難解答
參考文獻
6 表達譜分析的實時定量聚合酶鏈反應技術
6.1 簡介
6.2 方法和途徑
6.2.1 樣本篩選
6.2.2 提取RNA
6.2.3 臨床樣本和環境樣本
6.2.4 逆轉錄
6.2.5 SYBR Green I染料檢測的螢光定量PCR
6.2.6 寡核苷酸探針標記的定量PCR
6.2.7 定量方法
6.2.8 實時定量PCR的標準化
6.3 疑難解答
6.3.1 未擴增、擴增量少、擴增起步晚
6.3.2 缺少模板組或陰性對照組
6.3.3 無逆轉錄酶對照組
6.3.4 形成引物二聚體
6.3.5 SYBR Green I溶解曲線出現多峰
6.3.6 在樣本重複實驗3次,至少5倍對數稀釋情況下,相關係數<0.98,其標準曲線不可信
6.3.7 不穩定的擴增曲線圖或大幅度的井間變化
參考文獻
7 哺乳動物細胞中的基因表達
7.1 簡介
7.1.1 人工染色體和轉基因技術
7.1.2 基因轉移和表達
7.1.3 位置效應和核染色質
7.1.4 組織特異性調控元件
7.1.5 持續表達和染色質絕緣體
7.2 方法和途徑
7.2.1 哺乳動物細胞的位點特異性染色體重組
7.2.2 質粒要求
7.2.3 染色體轉移
7.3 疑難解答
參考文獻
8 酵母雙雜交在分析大量蛋白質相互作用中的套用
8.1 概述
8.2 方法和途徑
8.2.1 建立大量“誘餌”或“獵物”蛋白克隆
8.2.2 生成兼容性重組插入用於缺口修復克隆
8.2.3 缺口修復反應
8.2.4 陽性轉化株鑑定
8.2.5 酵母菌落PCR
8.2.6 “誘餌”與“獵物”克隆自激活檢測
8.2.7 靶向矩陣法Y2H篩選
8.3 疑難解答
參考文獻
9 蛋白質功能預測
9.1 引言
9.2 方法和途徑
9.2.1 注釋策略
9.2.2 多個蛋白質識別系統的套用
9.2.3 序列同源性
9.2.4 系統發生關係
9.2.5 序列衍生的功能和化學性質
9.2.6 蛋白質‐蛋白質相互作用圖譜\n 9.3 故障排查
參考文獻
10 通過基因工程小鼠闡釋基因功能
10.1 引言
10.2 方法和途徑
10.2.1 小鼠目標基因剔除原理
10.2.2 小鼠基因打靶策略
10.2.3 通過重組工程從BAC中獲得DNA
10.2.4 胚胎幹細胞和胚胎成纖維細胞培養
10.2.5 嵌合體配對和下游的套用
10.3 疑難解答
參考文獻
11 基因轉移的載體系統
11.1 引言
11.2 方法和途徑
11.2.1 理想的基因治療載體
11.2.2 質粒設計
11.2.3 病毒載體
11.2.4 非病毒DNA載體
11.2.5 鑑定非病毒載體的物理性質
11.2.6 最佳化體外基因傳遞
11.2.7 最佳化方案
11.2.8 報告基因和分析
11.2.9 細胞毒性分析
11.2.10 非病毒載體的未來發展
11.3 疑難解答
11.3.1 一般問題
參考文獻
12 基因治療策略：構建AAV特洛伊木馬
12.1 簡介
12.1.1 基因治療的常規策略：基本方法
12.1.2 基因治療策略：基因轉染細胞
12.1.3 病毒載體
12.1.4 重組AAV病毒的生產、純化和滴度檢測
12.2 方法和途徑
12.3 疑難解答
參考文獻
13 蛋白質組學技術簡介
13.1 簡介
13.2 方法和途徑
13.2.1 基於凝膠的策略
13.2.2 LC/MS策略
13.2.3 基質輔助雷射解吸電離(MALDI)成像和概覽
13.3 故障診斷
13.3.1 若干分解出來的特徵和修飾
13.3.2 樣品消耗、蛋白質識別及覆蓋深度
13.3.3 統計強度
13.3.4 結論
參考文獻
索引
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