《單細胞蛋白質組學研究的新方法與新技術》是依託東南大學,由肖忠黨擔任項目負責人的面上項目。
基本介紹
- 中文名:單細胞蛋白質組學研究的新方法與新技術
- 項目類別:面上項目
- 項目負責人:肖忠黨
- 依託單位:東南大學
- 批准號:20875014
- 研究期限:2009-01-01 至 2009-12-31
- 申請代碼:B0404
- 支持經費:15(萬元)
- 負責人職稱:教授
《單細胞蛋白質組學研究的新方法與新技術》是依託東南大學,由肖忠黨擔任項目負責人的面上項目。
《單細胞蛋白質組學研究的新方法與新技術》是依託東南大學,由肖忠黨擔任項目負責人的面上項目。中文摘要蛋白質組學是研究細胞內蛋白質的組成、結構及其自身特有的活動規律的一門新興學科,是人類基因組學的必然延伸。單細胞研究能更準確...
在單個細胞水平揭示細胞異質性,是當前生命科學領域的研究的重點之一,也是生命分析化學面臨的巨大挑戰和機遇。本項目在國際上率先提出並建立了單細胞化學蛋白質組學新技術新方法,揭示具有重要功能的蛋白質家族在單細胞水平的表達異質性。從動物或培養細胞系獲取的細胞群,通過特定設計的活性小分子探針標記後,用微流控...
單細胞蛋白質組研究能夠甄別細胞間蛋白質表達的個體差異,對於研究細胞分化、個體發育以及癌症早期診斷等具有重要科學價值。本課題提出基於活性小分子探針的微流控晶片單細胞蛋白質組學新方法研究。設計併合成活性小分子,該小分子在結構上由串聯的3個功能域(ABC)構成:A域為嚮導區,通過識別靶蛋白質與其形成非共價結合...
定位、溶胞和蛋白質的二維正交分離,並在第二維採用線上螢光標記技術,簡化了蛋白質樣品前處理,為線上高靈敏雷射誘導螢光檢測奠定基礎。採用上述平台技術,對蛋白質組進行解析,重點探索運用該技術獲取單細胞水平的蛋白質組指紋圖譜,為進一步科學研究、疾病診斷,藥物開發和篩選提供創新平台支撐。
如果能夠把人體252種細胞內的全部蛋白質都給鑑定出來,那么我們就有可能真正知道人類基因組的所有基因。但是這樣一來,基因組和蛋白質組形成了“循環定義”:蛋白質組是以基因組擁有的所有基因的表達產物來構成,而所有基因的確定又必須通過蛋白質組來給予肯定。蛋白質組學的研究技術目前還有很多不完善之處,許多新技...
同理,不同細胞在不同生理或病理狀態下所表達的蛋白質的種類也不盡相同。蛋白質是基因功能的實施者,因此對蛋白質結構,定位和蛋白質-蛋白質相互作用的研究將為闡明生命現象的本質提供直接的基礎。生命科學是實驗科學,因此生命科學的發展極大地依賴於實驗技術的發展。以DNA序列分析技術為核心的基因組研究技術推動了...
單細胞蛋白質是單細胞或具有簡單構造的多細胞生物的菌體蛋白的統稱。單細胞蛋白質曾被稱為發酵蛋白、生物合成蛋白、生物蛋白、石油蛋白、工業蛋白及菌體蛋白等。可供作飼料用的單細胞蛋白質微生物主要有酵母、真菌、藻類及非病原性細菌4大類。單細胞生物的結構和生活 1.單細胞生物的概念:肉眼很難看見,身體只有1...
只需配備現存的分離和檢測儀器即可達到對目標蛋白質組的分析。該方法可以進一步發展到對納升級樣品的取樣,從而可以套用於活體器官/組織、甚至是單細胞的目標蛋白質組分析。該方法的主要優點是目標明確,取樣體積極小,對於疾病診斷、刑事分析和活體分析等具有很強的實用性,對蛋白質組學研究將具有重要促進作用。
蛋白質組學系統 蛋白質組學系統是一種用於基礎醫學領域的分析儀器,於2016年3月1日啟用。技術指標 蛋白純化系統:電導檢測器電導率範圍 0-300 mS/cm,解析度 1 mS/cm;紫外檢測器波長範圍280nm±3nm,單波長 蛋白雙向電泳系統 一體化蛋白免疫印跡系統 酶標儀。主要功能 蛋白質組學。
藉助這些首創性分子成像方法,將有望實現細胞分子圖譜的繪製,並有望以納米的分辨研究活細胞內發生的各種動態過程,而這無疑將是繼基因組學、蛋白質組學之後研究細胞組學所需手段的一個重大突破,將對生命科學和醫學的發展產生深遠影響。結題摘要 細胞是生物體及生命活動的基本單元,對細胞的深入研究是揭開生命奧秘、...
5 針對單細胞敏感性的RNA擴增技術 6 表達譜分析的實時定量聚合酶鏈反應技術 7 哺乳動物細胞中的基因表達 8 酵母雙雜交在分析大量蛋白質相互作用中的套用 9 蛋白質功能預測 10 通過基因工程小鼠闡釋基因功能 11 基因轉移的載體系統 12 基因治療策略:構建AAV特洛伊木馬 13 蛋白質組學技術簡介 索引 彩版 ...
2014年,Fluidigm收購了DVS Sciences公司和CyTOF技術,邁進單細胞蛋白質分析領域。2015年,Helios 質譜流式系統面市,配備氣動上樣器,可進行流式管上樣,並且在操作性和穩定性方面大大提升,獲得用戶認可。2017年,Hyperion組織成像質譜流式系統發布,標誌著質譜流式技術正式跨入空間蛋白組學領域。2021年,下一代質譜流...
發展具有自主智慧財產權的多相微流控液滴操控和檢測新方法,建立具有超微量、高靈敏、高通量、自動化特點的集成化多相微流液滴分析系統,並將其套用於高靈敏的臨床診斷、超微量低成本的藥物研發和生物醫學基礎研究等領域,為上述領域內相關瓶頸問題的解決作出重要貢獻,以實現發展學科前沿技術和深化拓展套用研究的雙重...
研究對功能蛋白/多肽的分離和富集技術,晶片線上蛋白酶解技術。提高該研究體系的分析靈敏度、選擇性和通量,以便更高效地分離與分析複雜蛋白質體系,主要集中於微型生物反應器和生物功能化微流控晶片的套用基礎性研究,為最終實現功能蛋白的分離分析、藥物篩選、分子相互作用以及單細胞蛋白質組分析提供技術平台。
細胞組學 細胞組學是細胞生物學名詞。
單細胞模式藻類基因組序列的確定,為研究這類生物適應脅迫環境的分子機制提供了新的切入點和大規模分子操作平台。本項目以單細胞模式藻類萊茵衣藻(綠藻)和集胞藻6803(藍藻)為材料,採用優勢互補的蛋白質組學研究手段,從分離純化的細胞質膜入手,通過極端pH及其它脅迫(如非均衡營養、鹽脅迫等)處理,構建上述...
(4)微流控晶片分析:開展生物體系中複雜物質的高效分離與高靈敏度檢測方法與技術研究,以微流控晶片為樣品前處理、分離和富集平台,利用高性能質譜為檢測手段,研究晶片與質譜接口技術和離子化方法,針對細胞、蛋白質組學、代謝組學及中藥等複雜體系,在微流控操控技術、表面修飾和質譜檢測與離子源研究方面有所突破...
建立組蛋白各種修飾的系統檢測和定量分析新方法;分析不同侵襲程度食管癌細胞組蛋白修飾圖譜,搜尋新的、未知的組蛋白修飾形式;針對新的修飾位點和重要的差異性修飾,構建並製備新的多肽分子探針,結合定量蛋白質組學技術,分析組蛋白特定修飾位點的相關結合蛋白,探索食管癌侵襲轉移與組蛋白修飾及結合蛋白的相關性。
例如同位素標記技術,電子顯微鏡技術,X射線衍射技術,電子計算機技術,超離心技術,電泳技術,層析技術,離子交換技術,質譜技術,分光光度計技術,細胞破碎技術,免疫學技術,胺基酸自動分析技術,核酸自動合成技術,蛋白質或核酸的順序測定技術,低溫技術,新型微生物培養技術,微生物計數技術,微生物快速鑑定技術,固定化...
研究方向 一、開發以質譜為核心技術的前沿方法。目前專注的研究項目為:1、單細胞蛋白質組學技術開發及其在生物醫學中的套用;2、基於新型捕獲離子遷移譜質譜(TIMSTOF)的糖蛋白鑑定與定量方法;3、基於碰撞橫截面數值(collision cross section)的數據獨立採集方法開發。 二、利用基於質譜的蛋白質組學及其他多組學技術的...
研究領域 1. CRISPR-Cas9基因編輯 近年來在研發基於單細胞全基因組測序的方法檢測CRISPR-Cas9基因編輯的脫靶效應,為基因編輯在臨床上的套用奠定了重要的基礎。2.生物信息學與基因組學 研究單細胞測序的新技術,包括單染色體測序,單細胞DNA/RNA整合基因組測序等。3.單分子DNA與蛋白質測序技術 研究無需擴增的單分子...
生物分離分析新材料與新技術課題組 該研究組研究方向主要集中在分離分析新材料的製備、微尺度生物分離分析和結構鑑定、生物質譜為基礎的聯用技術和方法及其在中藥生物指紋譜、修飾蛋白質組學、多肽組學分析中的套用。組內現有研究員3人,客座教授1人,副研究員2人,助理研究員1人,技術人員4人,在讀研究生和博士後...
隨著X-ray、NMR等實驗技術的的進步,蛋白質結構數據的數量日益增多,結構精度也越來越高,使得結構比較更為可行。已經發現許多蛋白的一級序列差異很大,難以通過序列比對進行分子進化的研究,但它們的空間拓撲結構仍然很相似,可以進行結構疊合比較、分析它們之間的進化關係,這表明結構比較可以比序列比較獲得更多更精確的...
2011年5月,出任華中科技大學黨委常委、副校長;同年受聘為國家重大科學研究計畫“活體蛋白質功能的光學分子成像新技術新方法研究”項目首席科學家。2012年,當選國際工程技術學會會士(IET Fellow)。2015年7月,入選中國科學院院士增選初步候選人名單。2016年6月20日,入選第二批國家萬人計畫科技創新領軍人才。2017年11...
研究生命過程中小分子物種對細胞信號轉導、蛋白質合成與代謝過程與途徑的影響,研究工作為臨床醫學、生物學提供重要的理論基礎與技術手段,對某些重大疾病早期診斷與預防以及植物生長機理研究具有重要的科學意義。 微納分離材料製備與質譜分析 本研究方向是以自組裝和可控組裝為方法,把具有特定幾何結構和物理化學功能的...
在過去的十年中,RNA-Seq技術迅速發展,並成為了在轉錄組水平上分析差異基因表達/mRNA可變剪下的不可缺少的工具。隨著下一代測序技術的發展,RNA-Seq技術套用範圍變得更加廣泛:一是在RNA生物學領域,RNA-Seq可以套用於單細胞基因表達/蛋白質表達/RNA結構的分析;二是空間轉錄組的概念也逐漸興起。長讀長/直接RNA-Seq...
第四節 研究腫瘤基因組學的技術及資料庫 305 第十九章 腫瘤轉錄組學 312 第一節 轉錄組和轉錄組學 312 第二節 腫瘤轉錄組學的主要任務 313 第三節 轉錄組學在腫瘤基礎與臨床研究中的套用 325 第四節 單細胞RNA測序 330 第二十章 腫瘤表觀遺傳學 332 第一節 表觀基因組學特徵 333 第二節 腫瘤相關的表...
一、細胞的破碎 二、提取與純化 第三章 實驗誤差控制 第一節 實驗誤差 一、實驗誤差 二、精密度和偏差 三、實驗誤差的來源 第二節 提高準確度的方法 一、減少系統誤差的方法 二、減少偶然誤差的方法 三、正確取捨有效數字 第四章 蛋白質研究技術與方法 第一節 蛋白質分離純化的一般方法 一、以蛋白質溶解度為...