商業結算資金審計是對商業企業往來資金結算的審核、稽查。商業結算資金是指在貨款和往來資金結算過程中占壓的資金。主要包括委託銀行收款和其他應收款。此種審計的目的在於： 檢查商業企業資金占壓的真實性和數額的正確性。
其審計的方法主要有：(1) 檢查占壓資金髮生和收回的控制制度，亦即占壓資金的產生有沒有適當的審批制度，對應收款有沒有催收的責任制度。(2) 抽查結算憑證，查驗憑證上金額的計算、過帳及帳簿金額計算的正確性。(3) 對有疑問、拖欠多時未收回的帳款，可採取發詢證函的方式，以便確認其真實性。 (4) 對應收款，尤其是個人應收款項的具體內容進行審核，了解有無非法情況發生。(5) 檢查長期不還的欠款數額、內容及原因。
