吳碘除了參與重大典史的編修，還多次參加科舉取士工作。乾隆四十二(1777年)、年和乾隆四十五年(1780年)，他兩次擔任順天府(今北京市)鄉試同考官，乾隆四十九年(1784年)又參加禮部主持的會試工作。他在京工作期間，為了給瓊州士子上京會試提供各種方便，也為瓊籍人進京辦事提供歇息之所，他邀集在京瓊籍人士捐資創建瓊州會館，大受瓊人讚揚。
吳碘還非常重視家鄉的興學育人，熱心興辦各種公益事業。他因長年累月、日以繼夜地潛心於經史研究和典籍編修工作，積勞成疾，不得不於40多歲便致仕歸養。他回鄉後，主講理台書院，傳授自己的學問。並拿出自己的錢重修府學宮，換以石柱；改建府城南城門上的文明樓(鼓樓)，使南城門大為改觀；辦瓊崖義學，讓府海地區貧苦學童免費入學；在府城北郊建大慈寺，讓孤寡殘疾者人寺安身養病，終有殮葬；在府城南建太史橋，並出資在他母親外家白沙村建東、西白沙兩座橋，方便了民眾來往。吳碘重視教育和家鄉公益事業都記入瓊州府志和瓊山縣誌，可惜他年僅50歲，於乾隆五十四年便病逝。
