南京市衛生信息中心是南京市衛計委直屬單位。
南京衛生信息學會主要組織開展衛生信息化方面的學術交流;舉辦各種形式的培訓班,開展衛生信息化技術、管理業務培訓;接受委託開展衛生信息化業務繼續教育;推廣衛生信息技術和成果的普及套用,開展衛生信息諮詢與技術服務;推薦優秀衛生信息人才、優秀學術論文、成果,反映衛生信息工作者意見和要求,維護其合法權益;接受委託組織開展衛生信息相關標準規範和新技術套用研究;接受委託承擔衛生信息系統建設項目的評審、論證、績效評估、成果鑑定;開展衛生信息化國際交流與合作;出版發行衛生信息書刊,編印學術資料;獨立或參與投資興辦符合本學會宗旨的事業;承擔江蘇省衛生廳、南京市衛生局、中國衛生信息學會、江蘇省衛生信息學會等相關單位委託的其他事項。