功能分析方法是通過分析事物(或系統)的功能及其作用進而認識事物(或系統)特性及內部結構的一種科學分析方法。其主要目的是為了更有效地套用該事物(或系統)，充分發揮其作用。現已成為科學研究中廣泛採用的基本方法。
由於任何一個系統的功能既與系統內部結構有關，又與環境有關，因此，功能分析可從兩個方面進行。①從功能與結構的關係中分析系統功能。一般說來，結構決定功能。當組成要素不同時，有不同的功能，如木材和鋼材具有不同的功能;當要素相同而結構不同時，有不同的功能，如金剛石和石墨(都由碳原子組成)具有不同的功能;不同層次的結構，有不同的功能，如省政府和縣政府就有不同的功能;同一功能，還可由不同的結構來表達和實現，如公共運輸既可用汽車，也可用電車，又如計時，既可用機械錶，也可用電子表。②從系統與環境的關係中分析系統功能。由於系統與環境發生著物質、能量和信息交換，因此可從輸入和輸出分析系統的功能。輸入說明環境對系統的影響，可是變換和輸出，不僅能反映輸入的影響，而且也能反映系統結構和調節機制的作用。系統的輸出必須適應環境的需求，如果不適應，還要反作用於系統，改變系統的功能。功能分析應與結構分析相互結合，才能達到全面認識系統的目的。目前已廣泛套用於自然科學和社會科學研究中。
