共同利用共同研究基地(Joint Usage/Research Center),是日本政府在全國設立並選拔的一系列頂尖國立、公立和私立大學附屬研究所、研究中心的總稱。超越了所屬單一大學的界限,這些研究機構的設備、資料、數據等可以與日本全國的研究者共享、共同利用。與此同時,他們直接受到日本政府的大力科研經費支撐。
平成20年7月,文部科學省統籌了日本全國的頂尖國公私立大學,正式啟動了此項目,以推進全國的學術研究和科研創新。截止2014年,日本全國共設定了95個共同利用共同研究基地,他們分別由附屬於全國的29所國立大學和17所公私立大學的上百所知名科研機構組成,且個別共同利用共同研究基地由多所研究機構共同組成。