《信息動力學與生物信息學——蛋白質與蛋白質組的結構分析》是2011年科學出版社出版的圖書,作者是沈世鎰、胡剛、王奎、高建召。
基本介紹
- 書名:信息動力學與生物信息學——蛋白質與蛋白質組的結構分析
- 作者:沈世鎰、胡剛、王奎、高建召
- ISBN:978-7-03-031680-6
- 頁數:589
- 定價:98
- 出版社:科學出版社
- 出版時間:2011年
- 裝幀:精裝
- 開本:B5
內容簡介,目錄,
內容簡介
本書主要內容由四部分組成。第一部分是建立信息動力學的一般理論,說明其來源與意義,及其一般內容與方法,由此形成其理論體系。第二~四部分是對蛋白質進行結構分析,包括對蛋白質一級結構與空間結構的分析,空間結構又分為三維結構與空間形態結構兩部分內容,其中涉及一系列的信息動力學問題與其他多種不同類型的數學問題,也與生物、醫學與醫藥衛生中的一些重要問題密切相關。附錄是對物理、化學與生物學中的一些基本知識的介紹,可供不同專業的讀者參考,也為本書其他各章所直接引用。
本書涉及大量生物信息資料庫的計算,許多計算結果與彩色圖像無法在正文中給出,因此附有光碟一張,作為正文的補充與說明。
本書可供數學、生物學、醫學、計算機科學等專業的高年級本科生、研究生、教師和科研工作者閱讀參考。
本書涉及大量生物信息資料庫的計算,許多計算結果與彩色圖像無法在正文中給出,因此附有光碟一張,作為正文的補充與說明。
本書可供數學、生物學、醫學、計算機科學等專業的高年級本科生、研究生、教師和科研工作者閱讀參考。
目錄
《數學與現代科學技術叢書》序
前言
第1章 概論
1.1 常用符號
1.1.1 英文大、小寫字母與希臘字母的表示
1.1.2 數學函式公式與符號的表示
1.1.3 一些重要的單位符號
1.2 主要內容與結果
1.2.1 ID的理論要點
1.2.2 蛋白質一級結構的語義分析
1.2.3 蛋白質空間結構的ID分析
1.2.4 蛋白質空間結構的動力學問題
1.2.5 蛋白質的三維結構研究
1.2.6 蛋白質空間形態的研究
1.3 其他問題的說明
1.3.1 關於資料庫與數據處理中的一些問題
1.3.2 對本書附帶光碟的說明
第一部分 基本原理與方法
第2章 ID與生物信息學
2.1 ID概述
2.1.1 ID的目的與意義
2.1.2 ID與物理學
2.1.3 ID的主要研究方法
2.1.4 ID所存在的問題與注意事項
2.2 生物信息學簡介
2.2.1 生物信息學的研究目標與特徵
2.2.2 生物信息學的範疇與內容
2.2.3 後基因組研究中的一些問題
2.3 對光碟的說明
2.3.1 資料庫的選擇與預處理
2.3.2 對光碟中檔案的說明
2.3.3 光碟閱讀的注意事項
第3章 ID的基本原理與方法
3.1 ID的研究對象與資料庫的類型與要素
3.1.1 資料庫的類型與結構特徵
3.1.2 資料庫的基本要素
3.1.3 人類自然語言文字與生物信息語言的比較
3.2 信息統計分析法
3.2.1 IDF的一般定義與性質
3.2.2 三種特殊類型的IDF
3.2.3 由互動信息與條件機率產生的IDF
3.2.4 IDF的若干性質
3.2.5 局部詞與局部詞詞庫
3.3 組合分析法與圖論的概述
3.3.1 組合分析法的目的、內容與意義
3.3.2 有關圖與樹的基本知識
3.4 資料庫的核心詞與核心詞詞庫
3.4.1 有關數據結構的記號與說明
3.4.2 核心詞的定義與性質
3.4.3 核心詞詞庫遞推計算法
第4章 語義分析概論
4.1 詞與詞法分析要點
4.1.1 詞庫的詞法與句法分析的幾個基本概念
4.1.2 有關詞法分析的一些定義、記號與模型
4.1.3 詞庫中詞的網路結構關係
4.1.4 有關極小樹網圖結構的一些定義
4.1.5 核心詞的詞法分析
4.2 詞與句的結構關係與同源蛋白質組的類型分析
4.2.1 詞與句的關係資料庫
4.2.2 由關係資料庫作有關語法問題的討論
4.2.3 網路結構中的布爾代數
4.3 句或蛋白質的信息動力函式(SIDF或PIDF)
4.3.1 引進PIDF的基本思想及其定義
4.3.2 PIDF的隨機分析概述
4.3.3 PIDF的運動及其他類型的分析
……
第二部分 蛋白質一級結構研究中的ID方法
第三部分 蛋白質的三維結構分析
第四部分 蛋白質的空間形態
參考文獻
索引
前言
第1章 概論
1.1 常用符號
1.1.1 英文大、小寫字母與希臘字母的表示
1.1.2 數學函式公式與符號的表示
1.1.3 一些重要的單位符號
1.2 主要內容與結果
1.2.1 ID的理論要點
1.2.2 蛋白質一級結構的語義分析
1.2.3 蛋白質空間結構的ID分析
1.2.4 蛋白質空間結構的動力學問題
1.2.5 蛋白質的三維結構研究
1.2.6 蛋白質空間形態的研究
1.3 其他問題的說明
1.3.1 關於資料庫與數據處理中的一些問題
1.3.2 對本書附帶光碟的說明
第一部分 基本原理與方法
第2章 ID與生物信息學
2.1 ID概述
2.1.1 ID的目的與意義
2.1.2 ID與物理學
2.1.3 ID的主要研究方法
2.1.4 ID所存在的問題與注意事項
2.2 生物信息學簡介
2.2.1 生物信息學的研究目標與特徵
2.2.2 生物信息學的範疇與內容
2.2.3 後基因組研究中的一些問題
2.3 對光碟的說明
2.3.1 資料庫的選擇與預處理
2.3.2 對光碟中檔案的說明
2.3.3 光碟閱讀的注意事項
第3章 ID的基本原理與方法
3.1 ID的研究對象與資料庫的類型與要素
3.1.1 資料庫的類型與結構特徵
3.1.2 資料庫的基本要素
3.1.3 人類自然語言文字與生物信息語言的比較
3.2 信息統計分析法
3.2.1 IDF的一般定義與性質
3.2.2 三種特殊類型的IDF
3.2.3 由互動信息與條件機率產生的IDF
3.2.4 IDF的若干性質
3.2.5 局部詞與局部詞詞庫
3.3 組合分析法與圖論的概述
3.3.1 組合分析法的目的、內容與意義
3.3.2 有關圖與樹的基本知識
3.4 資料庫的核心詞與核心詞詞庫
3.4.1 有關數據結構的記號與說明
3.4.2 核心詞的定義與性質
3.4.3 核心詞詞庫遞推計算法
第4章 語義分析概論
4.1 詞與詞法分析要點
4.1.1 詞庫的詞法與句法分析的幾個基本概念
4.1.2 有關詞法分析的一些定義、記號與模型
4.1.3 詞庫中詞的網路結構關係
4.1.4 有關極小樹網圖結構的一些定義
4.1.5 核心詞的詞法分析
4.2 詞與句的結構關係與同源蛋白質組的類型分析
4.2.1 詞與句的關係資料庫
4.2.2 由關係資料庫作有關語法問題的討論
4.2.3 網路結構中的布爾代數
4.3 句或蛋白質的信息動力函式(SIDF或PIDF)
4.3.1 引進PIDF的基本思想及其定義
4.3.2 PIDF的隨機分析概述
4.3.3 PIDF的運動及其他類型的分析
……
第二部分 蛋白質一級結構研究中的ID方法
第三部分 蛋白質的三維結構分析
第四部分 蛋白質的空間形態
參考文獻
索引