內容,十三科,註解,
內容
全書內容分兩大部分：一、通序大歸，二、別釋眾品。在通序大歸中，說三論的立義，不出破邪、顯正二轍。破邪是把邪計、邪執歸納為四類：(一)破外道執有實我、實法，其中：先述天竺邪因邪果、無因有果、有因無果、無因無果四執，後舉震旦《周易》、《老》、《莊》三玄，一一用佛理摧破它。(二)破毗曇雖達我空而執諸法實有。(三)破成實雖明人法二空而未能窮原盡理。(四)破大乘之墮於有所得見。如此，無論內道外道、大乘小乘，凡計有所得的都加遣破。其次顯正，說有人正、法正二義。三論的作者龍樹論師應《楞伽》、《摩耶》等大小乘經的懸記，建立正法，這是人正。三論是究竟無餘之說，這是法正。次就三論說有體正、用正二義。體正是說諸法實相無所得理，言忘慮絕，非真非俗，絕諸偏邪。用正是說為令眾生契無所得的理體，於無名相中強設名相，說真俗二諦來顯示它。如此，雖有體、用二正，要以破遣有所得見、顯示無所得理為顯正。
十三科
在別釋眾品中，有十三科：(一)經論相資，說諸佛為眾生失道而說經，菩薩為眾生迷經而造論。(二)經論能所絞絡，說經以二智為能說、二諦為所說，論以二慧為能說、言教為所說。而經論互相絞絡，或此能為彼所，或此所為彼能。(三)造論緣起，說龍樹、提婆為諸部異執迷失佛教的本意，因而造論破他們的迷情。(四)諸部通別，說《中論》通破大小二迷、通申大小二教，《十二門論》通破大迷、通申大教，《百論》通破障大小之邪、通申如來大小兩正，所以都是大乘通論。(五)眾論立名，說《大智度論》從所釋經、《中論》從理實、《十二門論》從言教、《百論》從偈句立名。(六)眾論旨歸，說《大智度論》以二慧(實慧、方便慧)、《中論》以二諦、《百論》以二智(權智、實智)，《十二門論》以境(實相)智(般若)為宗。(七)四論破申，說《中》、《百》、《十二門》三論通破眾迷、通申眾教，《大智度論》別破般若之迷、別申般若之教。又其中《百論》正破外、旁破內，餘二論正破內、旁破外。(八)別釋三論，說《中》、《百》、《十二門》論同具破邪、顯正、言教三義，所以合稱三論。(九)三論通別以《大智度論》和三論相對來說，則《智論》為別論、三論為通論。若專就三論說，則《百論》為通論之廣、《中論》為通論之次、《十二門論》為通論之略。(十)四論用假，說《大智度論》多用因緣假，《中論》、《十二門論》多用就緣假，《百論》多用對緣假。(十一)四論對緣，說提婆的出世，正為破斥當時盛興的外道，兼除小迷及小乘有所得見。龍樹的出世，為當時五百部盛興，破小迷，申大教，令回心向大。(十二)三論破緣，說有聞《百論》始舍罪福，終破空有而言下得悟無生；有聞《百論》後出家受經，方乃得悟；有聞《百論》不了尋經更起迷執，為《中論》所破，方乃得悟；有直至聞《十二門論》方乃得悟。(十三)《中論》名題，說此論的立名有廣有略，略但稱《中論》，中是所論的中道實相理，論是能論的言教。廣稱《中觀論》，由中道實相發生正觀，由內有正觀宣於口而為論。
吉藏於《玄義》外，尚著有《中》、《百》、《十二門》三論疏，分別就論中文句及其意義詳加解釋。
註解
古代《玄義》此書中土無註解，日本古代的佛教學人，研究此書甚盛，著有《檢幽集》七卷(證禪)、《鈔》三卷(貞海)、《要鈔》五卷(亡名)、《科注》七卷(薄祐)、《首書》二卷(鳳潭)、《玄談》一卷(明道)、《講話錄》二卷(前田慧雲)、《講義》一卷(村上專精)等。
當代國內對《三論玄義》的註解書籍主要有劉常淨老師著的《三論玄義記》，對《三論玄義》進行科判，是學習《三論玄義》的重要參考資料。
