《p53抑癌基因直接調控的miRNA靶基因的識別及電化學研究》是依託中山大學,由戴宗擔任項目負責人的面上項目。
基本介紹
- 中文名:p53抑癌基因直接調控的miRNA靶基因的識別及電化學研究
- 項目類別:面上項目
- 項目負責人:戴宗
- 依託單位:中山大學
中文摘要,結題摘要,
中文摘要
本項目以p53抑癌基因直接調控的miRNA靶基因的識別及分析為研究目的。篩選新的具有p53結合位點且調控p53抑癌基因上游轉錄因子和下游基因的miRNA。研究miRNA靶基因預測方法,包括:建立基於粒子群算法(PSO)特徵選擇和支持向量機(SVM)聯用技術等;構建整合預測模型,利用信息融合方法進行預測。建立p53抑癌基因調控的miRNA靶基因的電化學檢測新方法,包括:建立p53抑癌基因突變檢測新方法和多突變熱點同時檢測技術;發展實時跟蹤p53抑癌基因突變的動態檢測技術;研究miRNA的電化學檢測方法;研究p53抑癌基因突變與miRNA靶基因表達水平的關係;研究其它活性分子(包括藥物分子等)對腫瘤細胞的miRNA表達的影響。本課題研究將有助於更深入研究p53基因調控網路的分子機制與調控規律,為腫瘤的預測和診斷,以及藥物設計和篩選提供理論依據。
結題摘要
本項目以p53基因直接調控miRNA靶基因的識別及其分析為研究目的。研究了miRNA錯配能量圖譜,建立了系列基於核酸恆溫擴增技術的miRNA靈敏分析方法和細胞內miRNA的原位成像分析技術;發展了p53腫瘤抑制基因片段特異位點甲基化修飾靈敏電化學和螢光分析方法;研究了基因甲基化修飾動態檢測電化學技術;探索了藥物小分子對DNA甲基化酶(Dnmt3a)的影響。項目的研究取得以下幾方面進展:(1)開發了基於三重循環放大反應串聯的核酸擴增方法,非對稱恆溫指數擴增技術,以及基於環形錘狀對稱模板的恆溫指數擴增技術,實現了組織、血液、單細胞miRNA表達的靈敏分析。(2)將化學氧化與核酸恆溫指數擴增技術結合,建立了p53腫瘤抑制基因片段單特異位點甲基化檢測新方法(COEXPAR);通過設計多功能電化學分子信標,建立了方便快速的p53腫瘤抑制基因片段多特異位點甲基化修飾同時檢測技術。(3)基於DNA長程電子傳遞特性並結合溴代衍生化增敏,發展了基因甲基化修飾過程連續檢測電化學方法。(4)研究了小分子抑制劑對 Dnmt3a 酶活性的影響。研究成果發表SCI論文8篇,包括Nucleic Acids Res. 1篇,Anal. Chem. 2篇,TrAC-Trends in Anal. Chem. 1篇,Biosens. Bioelectron. 3篇,申請發明專利6件。本課題的研究實現了核酸恆溫擴增方法在擴增效率、特異性和擴增偏差的同步提升,實現單細胞水平miRNA的準確分析;改善了當前基因甲基化修飾分析技術操作繁瑣,成本高,耗時長等不足;提出了基因甲基化修飾動態檢測技術。本項目在miRNA和基因甲基化相關疾病的研究方面具有理論意義和實用價值。