dbEST

dbEST是GenBank的一個子資料庫,包含來源於不同物種的表達序列數據和表達序列標籤序列的其他信息。

基本介紹

  • 外文名:dbEST
  • 簡述:是GenBank的一個子資料庫
  • 包含:表達序列數據和表達序列標籤序列
  • 功能:提供新的基因組標誌物資源
人類表達序列標籤(EST)是由隨機選擇的600多個人腦互補DNA(complementary DNA,cDNA)自動生成的部分DNA序列。EST已被用於人類新基因的發現、人類基因組圖譜繪製和基因組序列編碼區識別。利用EST資料庫,人們發現了337條代表新基因的序列,包括與其他物種明顯相似的48條序列,如:酵母RNA聚合酶Ⅱ亞單位、果蠅的驅動蛋白、與翅緣發育有關的Notch基因和分裂相關的增強因子,以及小鼠酪氨酸激酶受體等序列,其中46條EST是經PCR擴增後繪製到染色體圖譜上的。這種利用cDNA特性的快速方法可以在幾年內方便、廉價地為人類絕大多說的基因加註標簽,為不同生物學研究領域提供新的基因組標誌物資源。

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