bZIP轉錄因子

bZIP轉錄因子

bZIP轉錄因子,即鹼性亮氨酸拉鏈轉錄因子,由鹼性(basic)區和亮氨酸拉鏈(leucine zipper)區兩部分構成。是普遍存在於真核生物中的一類多基因家族。

基本介紹

  • 中文名:bZIP轉錄因子
  • 外文名:bZIP transcription factors
  • 別名:鹼性亮氨酸拉鏈轉錄因子
結構,分類,

結構

bZIP轉錄因子,即鹼性亮氨酸拉鏈轉錄因子,由鹼性(basic)區和亮氨酸拉鏈(leucine zipper)區兩部分構成。其鹼性區高度保守,位於bZIP結構域的N端,約有16~20個鹼性胺基酸殘基(如賴氨酸、精氨酸),且含有核定位序列及DNA識別結構域,能特異結合DNA序列,其核心結合序列為ACGT。亮氨酸拉鏈區保守度較低,位於bZIP結構域的C端,由1個或多個七肽重複區構成1個α螺旋;每個七肽重複區包括1個亮氨酸或其它疏水殘基,如異亮氨酸、纈氨酸、甲硫氨酸等。疏水胺基酸之間產生疏水作用力使2個bZIP轉錄因子彼此纏繞成為二聚體,形成超捲曲結構。同一亞家族的bZIP單體結合形成同源二聚體,而不同亞家族bZIP單體相互結合形成異源二聚體。在不同的環境中,bZIP單體有選擇地相互結合形成不同的二聚體,並被賦予不同的功能。此外,磷酸化修飾可以影響bZIP轉錄因子的活性。有些植物的bZIP蛋白還共有轉錄激活域,如脯氨酸、谷氨醯胺及酸性胺基酸等結構域。bZIP轉錄因子發揮調控作用時,其二聚體C末端亮氨酸拉鏈區的2個螺旋纏繞在一起,與N末端鹼性區漸漸拉開距離形成“Y”型結構,並與靶基因啟動子區順式作用元件結合,激活或抑制靶基因的轉錄,從而影響植物各種生物學過程。

分類

對包括模式植物在內的幾種真核生物bZIP轉錄因子的研究發現,擬南芥(Arabidopsis thaliana L.)中的bZIP轉錄因子基因家族成員的數量是酵母、蠕蟲、人的4倍多。根據鹼性區及其它保守序列的相似性,Jakoby等利用MEME(Multiple em for motif elicitation)分析工具將擬南芥的75個AtbZIP轉錄因子分為A~I和S共10個亞家族。各亞家族的命名原則不同,一些亞家族的名稱來源於其主要成員,如ABF/AREB/ABI5、CPRF、GBF、HY5/HYH分別屬於A、C、G、H亞家族;另一些亞家族的名稱表示蛋白質的分子量,如S亞族代表蛋白質的分子量較小,B亞族代表蛋白質的分子量較大。同一亞家族成員之間具有一些共同特徵,如胺基酸序列長度相似、亮氨酸拉鏈的大小相近、能識別cis順式作用元件等。不同亞家族成員的結構和功能各不相同。隨著全基因組測序技術的進步,目前已在多種高等植物如擬南芥、玉米(Zea mays L.)、水稻(Oryza sativa L.)、大豆(Glycine max L.)等中發現了bZIP轉錄因子,參照Jakoby的分類方法可將它們分為不同的亞家族。

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