RIP-seq

RNA Immunoprecipitation是研究細胞內RNA與蛋白結合情況的技術，是了解轉錄後調控網路動態過程的有力工具，能幫助我們發現miRNA的調節靶點。

基本介紹

• 外文名：RIP-seq
• 全稱：RNA Immunoprecipitation
• 研究對象：RNA-蛋白複合物
• 類似套用：染色質免疫沉澱ChIP技術

這種技術運用針對目標蛋白的抗體把相應的RNA-蛋白複合物沉澱下來，然後經過分離純化就可以對結合在複合物上的RNA進行測序分析。

RIP可以看成是普遍使用的染色質免疫沉澱ChIP技術的類似套用，但由於研究對象是RNA-蛋白複合物而不是DNA-蛋白複合物，RIP實驗的最佳化條件與ChIP實驗不太相同（如複合物不需要固定，RIP反應體系中的試劑和抗體絕對不能含有RNA酶，抗體需經RIP實驗驗證等等）。RIP技術下游結合microarray技術被稱為RIP-Chip，幫助我們更高通量地了解癌症以及其它疾病整體水平的RNA變化。