NDM基因特徵及進化
2009年首次發現的blaNDM-1基因片段長度為813個鹼基,編碼269個胺基酸,
相對分子質量約27500,其活性狀態為單體,成熟多肽等電點為6.9。酶動力學結果顯示:該酶與青黴素、
頭孢菌素和
碳青黴烯類藥物
亞胺培南和美羅培南親和力高,水解活性強。隨後,在世界各地又發現了NDM的新亞型。比如在歐洲鮑曼不動菌株中發現的NDM-2,在澳大利亞
大腸桿菌中發現的NDM-3,印度大腸桿菌中發現的NDM-4等。2013年1月15日在我國香港也發現輸入性NDM-4
泛耐藥腸桿菌科細菌。截止2013年1月,世界各地報導的。NDM已經發展到7種亞型,NDM-1~NDM-7。7種基因亞型間存在1~2個胺基酸鹼基的變異,其底物譜和水解能力和NDM-1基本相同。7種基因亞型的聚類關係、宿主菌及首次分離地點如圖1所示:
NDM的跨地域、跨種屬傳播
Walsh對產生NDM-1的肺炎克雷伯桿菌進行遺傳學分析後發現,blaNDM-1基因位於一個180kb的質粒上,進一步的實驗證明該質粒很容易轉移到其他細菌中,使得獲得該耐藥質粒的菌株具有和供體肺炎克雷伯桿菌相似的抗菌藥物敏感譜。此外,研究人員之後又在患者糞便的大腸桿菌中找到了含有blaNDM-1基因的長度為140kb的質粒,這可能就是耐藥質粒在患者體內發生菌種間接合的結果。從而研究者推測,含有blaNDM-1基因的質粒能在不同的菌株之間穿梭傳遞,並且還可以在轉移中發生重組,因而具有廣泛的細菌宿主。隨後的流行病學研究證實了這一推測,從2009年NDM-1在印度首次發現,NDM已經在全球五大洲的大部分國家或地區被發現。其宿主菌也擴展到
大腸埃希菌、
肺炎克雷伯菌、
不動桿菌、
銅綠假單胞菌、
陰溝腸桿菌、
變形桿菌、弗勞地構椽酸菌、
產酸克雷伯菌、摩根摩根菌、普羅威登菌等大部分
革蘭氏陰性菌和腸球菌等
革蘭氏陽性菌。在印度還發現了攜帶NDM的志賀氏菌和
霍亂弧菌。
我國“NDM超級耐藥菌”的流行狀況
截止2013年1月25日,我國香港地區報導了20多例NDM感染病例,大陸地區也有多起NDM感染病例報告,但尚缺乏系統性統計資料。2010年10月,通過國家科技重大專項“傳染病監測技術平台”項目作支撐,衛生部組織對2009年1月至2010年12月收集的菌株進行產NDM-1泛
耐藥細菌檢測,結果顯示,篩查的32408株細菌中,共檢出24株攜帶blaNDM-1基因的細菌,檢出率為0.07%(24/32408),分別為不動桿菌20株,
產酸克雷伯桿菌2株和
屎腸球菌2株。
“NDM超級耐藥菌”感染的臨床特徵
發現的NDM宿主菌主要為非致病菌或
條件致病菌,易感人群主要包括疾病危重、入住重症監護室、長期使用抗菌藥物、插管、機械通氣等患者。主要感染類型包括
泌尿道感染、傷口感染、
醫院獲得性肺炎、
呼吸機相關性肺炎、血流感染、導管相關感染等。感染“NDM超耐藥菌”的患者的臨床表現與敏感菌感染沒有差別。“NDM超耐藥菌”對絕大部分
β-內醯胺類抗菌藥物耐藥,且通常同時攜帶其他類型的耐藥基因,表現為對臨床絕大部分抗菌藥物耐受的泛耐藥,這也使得臨床上難以找到有效的治療措施,一旦感染,抗感染治療困難,病死率很高。
圖2:改良Hodge實驗顯示NDM-1碳青黴烯酶