科學計算與計算機套用系成立於1993年，1979年，隨著科學計算與計算機科學與技術的發展，為適應資訊時代的要求和學科發展的需要，計算數學研究室和軟體教研室由數學系分離出來，成立計算機科學系。隨後經過多年的發展，科學計算與計算機套用繫於1993年從計算機科學系分離出來，獨立建系。
目前，全系現有教師20餘名，其中博士導師4名，教授4名，副教授8名，一人聘為長江學者講座教授，擁有信息科學、計算科學、計算機套用三個教研室，以及科學計算與計算機套用研究所。也是廣東省計算數學學會掛靠單位。本科專業有《信息與計算科學》，研究生專業有《計算數學》和《信息計算科學》。還有網路教育《計算機科學與技術》專業（本、專科），成人教育《信息與計算科學》、《軟體工程》、《計算機套用》（本、專科）等。其中，本科專業《信息與計算科學》於2001年被評為廣東省高等學校首批IT類名牌專業，研究生專業《計算數學》是全國同類學科中第一批獲得碩士點（1978年）和博士點（1984年）的單位，《信息計算科學》是2003年新增的碩士點和博士點，《計算數學》學科於2003年被評為廣東省重點學科。此外，相關一級學科數學是博士點授予權單位，擁有博士後流動站。本學科於1997年和2002年主辦了兩屆廣州計算數學國際會議，每屆均有來自五大洲的13、14個國家和地區的專家學者出席會議，產生良好的國際學術影響。
科學計算與計算機套用系師資隊伍優良，教學和科研成果顯著，有鮮明的辦學特色，人才培養質量好，學生就業率高。畢業生能在科技、教育、信息產業、經濟金融等部門從事研究、教學、套用開發和管理工作，或繼續攻讀研究生學位。
