HLA錯配作用是移植供者和受者間HLA型別不相匹配的過程。供、受者間HLA錯配越多,移植物存活率越低,存活時間越短。HLA的識別功能實指在免疫反應中特有的協同作用。抗體在B細胞生成,但在多數情況下,需要巨噬細胞和T淋巴細胞參與。其過程是:抗原經巨噬細胞處理後,抗原信息傳遞給T輔助細胞,後者再將信息傳給B細胞。
HLA類抗原分布於所有有核細胞。其抗原特異性在於肽鏈抗原決定簇的特定胺基酸順序。這些抗原可被外來物質例如某種病毒或化學物質加以改變,當這些基因產物被改變之後,便成為自身免疫原,成為免疫排除的靶子。可見,耙功能的實質在於“識別自我”,以保證機體的完整性。因此,分布於所有細胞及其多態性這一特點十分重要。