DNA條碼

DNA條碼

黑白紋相間的條形碼是我們再熟悉不過的了。在超市的收銀台,收銀員用掃瞄器掃描商品上的條形碼,無論你買的是牛奶還是番茄湯罐頭,掃一下便知。8年前,生物學家研發出他們自己的條形碼,同樣用於身份識別,但這種條形碼並不是印在物品上,而是存在於所研究的動植物DNA中。

基本介紹

  • 中文名DNA條形碼
  • 外文名:DNA
  • 支持項目:“種質資源庫的植物DNA條形碼”
  • 支持機構:中國科學院大科學
  • 時間:2009年8月起
DNA條碼
作為對國際生命條形碼聯盟這一建議的回應,2009年8月起,在中國科學院大科學裝置開放研究項目“依託種質資源庫的植物DNA條形碼研究”的支持下,中國科學院昆明植物研究所李德銖研究員聯合全國19個科研院所和高校62名研究人員組成的“中國植物條形碼研究團隊(ChinaPlantBOLGroup)”,深入開展了種子植物DNA條形碼的研究。
研究團隊根據對主要來自中國的種子植物75科141屬1757種共約6286個樣本(每個種至少2個樣本)的四個DNA候選條形碼片段(rbcL,matK,trnH-psbA和ITS)引物通用性、序列質量和物種分辯率等的綜合分析,發現三個質體DNA候選條形碼片段具有較高的通用性;核糖體核DNA候選條形碼ITS在被子植物中的通用性較高,而在裸子植物中稍低。研究還發現,ITS具有最高的物種分辯率,與三個質體DNA條形碼片段的任何一個組合均可分辨69.9-79.1%的物種,顯著高於rbcL+matK條形碼組合49.7%的解析度。此外,ITS的部分序列ITS2也表現出較高的物種解析度。
因此,研究團隊建議將ITS作為種子植物的核心DNA條形碼(rbcL+matK+ITS),同時強調了利用多個樣本取樣和不同遺傳方式的DNA片段開展植物DNA條形碼研究的重要性。該文於本月18日線上發表於美國《國家科學院院刊》。
繼2009年由10個國家24個研究單位52名研究人員組成的CBOL植物工作組對7個植物DNA候選條形碼片段評價後,“中國植物條形碼研究團隊”的此項研究是組織規模最大、獲得數據量最豐富和參加人員最多的一項。該文也是該研究團隊2011年5月在“JournalofSystematicsandEvolution”組織發表“中國植物DNA條形碼研究”專輯後又一重要研究成果。
國際生命條形碼聯盟植物工作組主席PeteHollingsworth教授應邀發表專題評論,對中國研究團隊的工作給予了高度評價。他指出,研究團隊通過大樣本取樣的比較分析,對ITS序列的優缺點進行了綜合評估,對將ITS納入植物條形碼的常規運用提供了有說服力的研究案例。他強調,該文的發表代表了將DNA序列數據納入植物物種水平分類和鑑定常規套用邁出的重要一步。

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