CADCS子系統(CADCS subsystem)表達CADCS總體系統的一部分功能.當CADCS軟體系統過大時，可按內容分類或按控制系統設計與使用方便分類，稱每一類為一個子系統，例如CADCSC軟體系統就是按內容分成若干個子系統。
由若干個子系統集成為一個CADCS軟體系統時，要考慮軟體系統對子系統的驅動與控制、系統與子系統之間以及不同子系統之間的通信、功能命令與人機互動界面的一致性等.對已分別獨立設計的子系統進行集成是一件很困難的事情，對功能與人機互動界面很難給出好的結果.如果進行總體系統設計時，就考慮到子系統的結構及其可擴展性，那就會有一個好的集成效果.但是，由於其總體系統已被確定，當擴展子系統時，還會受到局限，比較好的方法是設計一個自動生成系統，可按實際情況生成滿足要求的子系統.
