Bacmid

Bacmid

Bacmid, 是Baculovirus plasmid的縮寫。桿狀病毒質粒 [帶有桿狀病毒基因組的質粒,可在細菌和昆蟲細胞之間穿梭]

基本介紹

  • 中文名:桿狀病毒質粒
  • 外文名:Baculovirus plasmid
  • 英文縮寫: Bacmid
  • 縮寫分類 : 生物科學
  • 類別:病毒
提取,獲得重組病毒的方式,
縮寫
英文全稱:Baculovirus plasmid
最初獲得Bacmid策略圖最初獲得Bacmid策略圖
中文解釋:桿狀病毒質粒,簡稱“桿粒”

提取

Baculovirus plasmid簡易提取方法:
挑白斑搖菌8h左右(一般會過夜搖),取2ml菌液,12000rpm ,30s,棄上清即可
1.溶液I—溶菌液:(加 300ul 將離心完的菌液混勻)
溶菌酶:它是糖苷水解酶,能水解菌體細胞壁的主要化學成分肽聚糖中的β-1,4糖苷鍵,因而具有溶菌的作用。當溶液中pH小於8時,溶菌酶作用受到抑制。
葡萄糖:增加溶液的粘度,維持滲透壓,防止DNA受機械剪下力作用而降解。
EDTA:(1)螯合Mg2+、Ca2+等金屬離子,抑制脫氧核糖核酸酶對DNA的降解作用(DNase作用時需要一定的金屬離子作輔基);(2)EDTA的存在,有利於溶菌酶的作用,因為溶菌酶的反應要求有較低的離子強度的環境。
2.溶液II-NaOH-SDS液(加300ul ,裂解5min,輕柔混勻,最好不要拿槍吹,上下顛倒混勻就行):NaOH核酸在pH大於5,小於9的溶液中,是穩定的。但當pH>12或pH<3時,就會引起雙鏈之間氫鍵的解離而變性。在溶液II中的NaOH濃度為0.2mo1/L,加抽提液時,該系統的pH就高達12.6,因而促使染色體DNA與質粒DNA的變性。
SDS(2%):SDS是離子型表面活性劑。它主要功能有:(1)溶解細胞膜上的脂質與蛋白,因而溶解膜蛋白而破壞細胞膜。(2)解聚細胞中的核蛋白。(3)SDS能與蛋白質結合成為R-O-SO3-…R+-蛋白質的複合物,使蛋白質變性而沉澱下來。但是SDS能抑制核糖核酸酶的作用,所以在以後的提取過程中,必須把它去除乾淨,防止在下一步操作中(用RNase去除RNA時)受到干擾。
3. 溶液III--3mol/L NaAc(pH4.8)溶液(主要是沉澱蛋白的,加後輕柔混勻,冰上放置15min): NaAc的水溶液呈鹼性,為了調節pH至4.8,必須加入大量的冰醋酸。所以該溶液實際上是NaAc-HAc的緩衝液。用pH4.8的NaAc溶液是為了把pH12.6的抽提液,調回pH至中性,使變性的質粒DNA能夠復性,並能穩定存在。而高鹽的3mol/L NaAc有利於變性的大分子染色體DNA、RNA以及SDS-蛋白複合物凝聚而沉澱之。前者是因為中和核酸上的電荷,減少相斥力而互相聚合,後者是因為鈉鹽與SDS-蛋白複合物作用後,能形成較小的鈉鹽形式複合物,使沉澱更完全。
4.將冰上放置的混合液12000rpm,10min離心,取上清加異丙醇(1:1),然後冰上放20min左右,再12000rpm離心10min
5.棄上清,加預冷的75%乙醇1ml洗一下(加完後應該能看到在EP管底部有一小塊白色的沉澱)
6.然後棄乙醇,留下白色沉澱(如果沉澱飄起,可以再12000rpm離心),涼乾,加50ul左右TE或雙蒸水
溶解片刻即可。(一般情況下應該有80-100ng/ul)

獲得重組病毒的方式

目前有兩種方式可以Bacmid獲得重組病毒:
1、通過轉座,將供體質粒上的目的基因片段在大腸桿菌中轉座到Bacmid上,然後提取Bacmid、轉染昆蟲細胞,獲得重組病毒。
2、直接將轉移質粒和線性化Bacmid共轉染昆蟲細胞,轉移質粒和Bacmid發生同源重組,產生重組病毒(見下圖)。
體內重組法獲得重組桿狀病毒示意圖體內重組法獲得重組桿狀病毒示意圖
常用的Bacmid及獲得重組病毒的程式比較見下圖:
Bacmid

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