各種細胞中都有一種核酸內切酶，它附著在自發丟失了單個嘌呤或嘧啶的位點上，這個無嘌呤（apurinic）和無嘧啶（apyrimidinic）位點就叫做AP位點。AP內切酶是細胞所必需的，因為自發地脫嘌呤作用經常發生，這種酶可以通過剪下AP位點的上的磷酸二酯鍵使鏈斷裂。這是起始切除-修復；進一步由3種酶：外切酶，DNA PolⅠ和連線酶進一步地進行修復。
由於AP內切酶修復途經的功效，它可能是其它修復途經最後的一步。這樣如果損傷的鹼基對能被切除的話，那么就留下一個AP位點，AP內切酶就能使野生型完全得到恢復。這就是糖基酶修復途徑。
