套用技術學院是於2017年8月在原數學與計算機科學系與原生命科學系的基礎上合併組建而成。學院下設院長、書記、專職組織員，副院長、副書記、辦公室、教學科、學生科等機構。目前，學院有專任教師56人，其中，教授3人，副教授19人，講師24人；在校學生1032人。學院開設有計算機套用技術、現代教育技術、物聯網套用技術、供用電技術、生物教育專業、園林技術專業、化學教育專業、套用化工技術專業、食品營養與檢測專業、保健品開發與管理專業、食品生物技術專業、園藝技術專業等專業。
其中：計算機套用技術專業與武漢偉創聚贏科技有限公司校企共建聯合培養，入校簽訂就業協定，保障對口就業及就業薪資。採用企業化管理模式，培養學生良好的職業素養，提前提升學生企業適應能力；課程按照項目貫穿式進行教學，在課堂中通過真實的項目案例學習最前沿的技能知識。打造技能+職業素養全面人才，提升學生企業適應能力及未來的發展潛力。
現代教育技術專業以構建專業化的現代教育技術專業教師的知識結構，強化套用能力培養，強化“五會”能力的培養：即培養會使用、會維護、會製作、會教學、會設計五種能力，勝任電視台、教育軟體、廣告傳媒公司的數字影視技術和設計等工作。
物聯網套用技術專業畢業生可以在物聯網企業、智慧型設備廠商、IT企事業單位從事物聯網軟硬體方面的工作。也可以參加專升本考試，繼續攻讀本科，提升自己的學歷。學校和達內教育集團合作，對物聯網套用技術專業採取聯合辦學的形式。學生參加各類專業技能競賽，2017年雲南省計算機作品賽中，《智慧型機器人定點/自助送餐系統》榮獲省級二等獎，國家級銅獎。
供用電技術專業為全國人才需求十大專業之一，以產學研融合的基於工作過程系統化的項目式理實一體教學模式進行教學，具有完備的校內校外實習實訓和聯合研發基地。
生物教育專業2017年專升本錄取比例全校名列前茅，教師團隊含教授3人、博士4人，依託滇西北相關行業企業合作辦學，取得了突出的社會生態效益，獲得雲南省高校特色專業等7項省級教學質量工程項目，畢業生深受用人單位的喜愛。
園林技術專業基於麗江豐富的野生植物資源，對園林植物進行育種、栽培、養護等方面的教學與研究，旨在培養園林景觀製圖識圖、園林景觀設計、施工實施與組織、園林植物養護等方面的技能型人才。
化學教育專業擁有一支職稱、年齡、學歷結構較為合理的師資隊伍，其中教授1人、副教授2人、博士1人。2017屆畢業生考取專升本人數分別為19人，此外考取公務員和特崗的學生人數也是年年攀升。
食品營養與檢測專業就業面廣，實用性強，具有就業競爭優勢，專升本率高；與本地企事業單位簽訂實習實訓基地協定，專業認知實習、頂崗實習等實踐項目在實習實訓基地完成；聘請校外專家擔任外聘教師，將企事業單位一線工作內容、前沿專業知識引入課堂，增加課程實用性。
