馬飛(南京師範大學生命科學學院教授)

馬飛，男，博士，南京師範大學生命科學學院教授，博士生導師。《Journal of Biological Systems》雜誌編委，江蘇省生物醫學工程學會生物信息學專業委員會委員，江蘇省動物學會理事，美國遺傳學會會員。2007年入選教育部新世紀優秀人才。主要從事功能基因與分子進化、比較基因組學與生物信息學等研究。

基本介紹

• 中文名：馬飛
• 國籍：中國
• 民族：漢族
• 出生日期：1968年6月
• 職稱：南京師範大學生命科學學院教授

人物經歷

2008年8月至今，南京師範大學生命科學學院特聘教授。

2004年8月至2008年8月，遼寧師範大學生命科學學院特聘教授。

2003年9月至2004年7月，廈門大學生命科學學院副教授。

2001年9月至2003年8月，清華大學生物信息研究所博士後, 合作導師李衍達院士。

1998年9月至2001年7月，南京農業大學學習，獲博士學位，導師程遐年教授。

1990年7月至1998年8月，安徽省白湖農科所，助理農藝師、農藝師。

1986年9月至1990年7月，安徽農學院學習，獲學士學位，導師鄒運鼎教授。

學術任職：

1. 《Journal of Biological Systems》雜誌編委；

2. 《Human Mutation》、《Journal of Theoretical Biology》等國際雜誌審稿人；

3. 江蘇省生物醫學工程學會生物信息學專業委員會委員，江蘇省動物學會理事，清華生物信息與精準醫學分會理事，美國遺傳學會會員。

研究方向

1 MicroRNA及選擇性剪接基因（Alternatively Spliced Gene）的分子進化與功能研究

採用分子生物學、比較基因組學以及生物信息學的理論與技術研究microRNA及選擇性剪接基因及其基因家族的分子進化，重點研究microRNA在文昌魚和海鞘發育和免疫中的功能和作用機制，並注重利用RNAi技術研究選擇性剪接的可能機制及其基因不同變體的功能。

2 比較基因組學（Comparative Genomics）

比較基因組學是通過對系統發育進化中重要物種基因和基因家族的比較分析，構建系統發育的遺傳圖譜，揭示基因、基因家族的起源和功能及其在進化過程中複雜化和多樣化產生的機制。我們研究組基於模式生物基因組的信息，採用DNA晶片和gDNA文庫、EST分析、基因重組與克隆、基因序列分析等方法和技術，開展基因和基因家族的進化、結構與功能的關係、人類疾病基因識別與功能等方面的研究。目的是了解所有基因和基因家族在基因組中的分布以及在演化進程中所產生的變化及其遵循的規律。

3 功能基因的克隆與表達

利用基因組學、蛋白質組學、生物信息學的技術與方法以及高效能表達克隆技術，系統地開展抗逆、抗病以及疾病等相關基因的高通量篩選與鑑定研究，目的是篩選和鑑定一批擁有自主智慧財產權的與抗逆、抗病以及經濟性狀基因相關的功能基因。

4 生物信息學（Bioinfomatics）

① 生物信息資料庫及軟體開發；

② 生物信息知識發現與數據挖掘；

③ 基因調控網路。

主要貢獻

主持科研項目

1. 教育部新世紀優秀人才支持計畫項目（No. NCET-07-0405）：文昌魚microRNA基因及其靶標的識別與比較基因組研究，2008~2010。

2. 國家自然科學基金（No. 30970348）：脊椎動物miRNA基因的起源與進化分析， 2010~2012。

3. 國家轉基因生物新品種培育科技重大專項子課題項目（2009ZX009-063B）：抗寒/抗旱相關基因的生物信息學分析及功能驗證，2009~2010。

4. 國家重點基礎研究發展計畫（973計畫）子課題 （No. 2010CB126206）：稻田生態系統對稻飛虱種群數量調控功能及機制， 2010~2014 (參加)。

5. 國家自然科學基金（No. 60575005）：可變剪接基因的模式識別與克隆驗證，2006~2008。

6. 國家自然科學基金（青年基金）（No.60305001）：真核生物選擇性剪接基因起源與進化的生物信息學研究，2004~2006。

7. 國家高技術研究發展計畫（No. 2007AA09Z428）：七鰓鰻藥用相關基因的篩選、鑑定與功能研究，2008~2010（副組長）。

8. 遼寧省高等學校優秀人才支持計畫項目（No. 2006R32）：文昌魚miRNA基因及其靶標的識別與比較基因組研究，2007~2009。

9. 遼寧省自然科學基金(No. 20072152)： 基於生物信息技術的七鰓鰻免疫基因挖掘與功能研究，2008~2010。

出版的著作

1. 程遐年，吳進才，馬飛 編著. 《褐飛虱的研究與防治》. 北京：中國農業出版社. 2003年9月（本書獲2002年國家科學技術學術著作出版基金的專項出版資助）。

2. 李慶偉，馬飛 編著.《鳥類分子進化與分子系統學》. 北京：科學出版社. 2007年8月。

3. 馬飛（參編）等. 十一五《生物信息學》教材. 北京：中國農業出版社. 2006年10月。

近年發表論文

1. Song S, Guo J, Li-Ling J, Huang Q, Chen X, Ma F*. Comparative component analysis of exons with different splicing frequencies. PLoS ONE, 2009, 4(4): e5387. doi:10.1371/journal.pone.0005387.

2. Ma X, Huang Q, Li-Ling J, Hou L, Ma F*. Systematic analysis of alternative promoters correlated with alternative splicing in human genes. Genomics, 2009, 93: 420-425

3. Liu X, Li-Ling J, Hou L， Li Q , Ma F*. Identification and characterization of a chitinase-coding gene from Lampetra japonicawith possible roles in gonadal development and innate immunity. Developmental and Comparative Immunology, 2009, 33（2）：257-263.

4. Huang Q, Guo J, Ge Q, Li-Ling J, Chen X, Ma F*. Comparative analysis of distinct noncoding characteristics potentially contributing to the divergence of human tissue-specific genes. Genetica, 2009, 136(1):127-134.

5. Zhou L, Li-Ling J, Huang H, Ma F*, Li Q*. Phylogenetic analysis of vertebrate kininogen genes. Genomics, 2008, 91(2):129-141.

6. Sun J, Wu Y, Wang J, Ma F, Liu X, Li Q. Novel translationally controlled tumor protein homologue in the buccal gland secretion of Lampetra japonica. Biochimie, 2008, 90(11-12): 1760~1768.

7. Huang Q, Li Y, Li-Ling J, Huang H, Ma F*. Analysis of disease-associated mutations in the coding regions of alternatively spliced human genes. Journal of Biological Systems, 2008, 16(2): 241~253.

8. Zhu L, Dai Y, Ma F, Li Q. ESTs analyses of Lampetra japonica liver and comparation transcriptome with the jawed vertebrates.Sci China C Life Sci, 2008, 51(1): 27-37

9. Yu S, Li-Ling J, Huang H, Chen X, Ma F, Li Q. Phylogenetic analysis of 48 gene families revealing relationships between Hagfishes, Lampreys, and Gnathostomata. Journal of Genetics and Genomics, 2008, 35 (5): 285~290.

10. Qu H, Ma F, Li Q. Comparative analysis of mitochondrial fragments transferred to the nucleus in vertebrate. Journal of Genetics and Genomics, 2008, 35(8): 485~490.

11. Tan S, Guo J, Huang Q, Chen X, Li-Ling J, Li Q, Ma F*. Retained introns increase putative microRNA targets within 3'UTRs of human mRNA. FEBS Letters, 2007, 581(6):1081~1086.

12. Cui B, Ma F*,Wang X, Sun Y, Yu L, Li-Ling J, Li Q. Phylogenetic Analyses of Fringillidae (Aves: Passeriformes) Using Mitochondrial tRNA Gene Sequences and Secondary Structure. Journal of Biological Systems, 2006, 14(3):413~424.

13. Xu Q, Ma F, Wang Y. Morphological and 12S rRNA gene comparison of two Branchiostoma species in Xiamen waters. Journal of Experimental Zoology (B): molecular and developmental evolution, 2005, 304B : 259~267.

14. Ma F*, Huang H, Xue C, Chen L, Lin L, Wang Y, Li Q, Li Y. Phylogenetic analysis of Na, K-ATPase: an insight into the mechanism for formation of multi-isoforms of protein complex. Journal of Biological Systems, 2005, 13(3): 299~312.

15. Zhuang Y, Ma F, Zhou M, Shen Y, Li Y. BioAgent:A biological data integration system based on multi-agent. Acta Electronica Sinica, 2005, 33(1):78~82.

16. Sun Y, Ma F, Xiao B, Zheng J, Yuan X, Tang M, Wang L, Yu Y, Li Q. The complete mitochondrial genomes sequences of Asio flammeus and Asio otus and comparative analysis. Science in China(Ser. CLife Sciences), 2004, 47(6): 510~520.

17. Ma F*, Zhuang Y, Chen L, Lin L, Li Y, Xu X, Chen X. Comparing Synonymous Codon Usage between Both Alternatively and Non-alternatively Spliced Gene of Human Genome. Journal of Biological Systems, 2004，12(1):91~103.

18. Ma F, Zhuang Y, Huang Y, Li Y. Exploring codon usage patterns of alternatively spliced genes in human chromosome 1. Tsinghua Science and Technology, 2004, 9(1)：98~107.

19. Ma F*, Zhuang Y, Li Y, Xu X, Chen X. Usage Patterns of Codons versus Complementary Codons among Cellular Organisms and Organelles. Journal of Biological Systems, 2003, 11(4):407~418.

20. Zhuang Y, Ma F*, Li-Ling J, Xu X, Li Y. Comparative analysis of amino acids usage and protein length distribution of alternatively and non-alternatively spliced genes across the six eukaryotic genomes. Molecular Biology and Evolution, 2003,20（12）：1978~1985.

獲獎記錄

1. 入選2007年度教育部新世紀優秀人才支持計畫；

2. 入選2006年度遼寧省優秀人才支持計畫；

3. 入選2006年度遼寧省高等學校優秀青年骨幹教師。