青海藏傳佛教五大教派之一，從宋末明初就傳人青海。據《安多政教史》等記載，早在元大德五年(1301年)，黃南州同仁縣隆務寺的創建者三旦仁欽的先祖拉傑扎那哇，受八思巴指派從衛藏來同仁地區傳教，在這裡建成薩迦派小寺。今尖扎縣賈加鄉的桑主寺，亦建於元初，早期為薩迦派寺院。原循化地區第一代文都千戶阿什旦，系西藏薩迦地方昆氏家族人，約於宋末元初率族遷來循化，相傳在薩班袞噶堅贊時期，薩迦派僧人在今循化街子村修建護法殿一座，為文都寺前身。今湟中縣西納川的西納家族在元代曾顯赫一時，明宣德年間，西納喇嘛卻帕堅贊建成薩迦派的西納寺，成為明代西納家族統治湟中地區的政教中心。此外，今海東其他縣和海南地區還有許多薩迦派活動的遺蹟。明末以來，隨著薩迦派的衰落和格魯派的嵋起，青海東部地區的薩迦派寺院先後改宗為格魯派。薩迦派在青海的主要傳播區是今玉樹地區。據調查，青海現存薩迦派寺院有29座，大型嘛呢康l座，且均在玉樹地區內。玉樹縣14座，稱多、囊謙兩縣各8座。絕大多數寺院修建在1250年至1531年之間，總計25座寺院，最早的是今囊謙縣東壩鄉的要畢日寺，建於1250年(南宋淳枯九年)，建於明清時期的4座，建於本世紀40年代末的只有一座小寺，現已不存。現玉樹縣的結古寺和稱多縣的尕藏寺是玉樹地區最大的薩迦派寺院，被譽為玉樹地區薩迦派主寺。薩迦派早期在玉樹地區的廣泛傳播，與薩迦第五祖師八思巴及其高徒們的頻繁活動密切相關。從元至元元年至十一年(1264—1274)，八思巴在玉樹東部地區的活動達9次之多，先後招徒傳法，賜贈法器、佛像，委其徒弟創建過不少薩迦派寺院，並應當地僧眾要求，原奉苯教或寧瑪派的一些寺院改宗為薩迦派。其間正是青海境內，也是玉樹地區薩迦派蓬勃發展的鼎盛時期。此時八思巴所招收的徒弟噶·阿尼膽巴，以後成為元初聲名顯赫的藏傳佛教高僧大德，被封為“國師”，圓寂後，追號“大覺普惠廣照無上膽巴帝師”，為其立有“敕賜龍興寺大覺普慈廣照無上帝師碑”。青海薩迦派寺院多數以西藏的薩迦寺、俄爾寺和本省的尕藏寺、結古寺為主寺，教義、教法、儀規等傳自西藏。
